Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHX1

PUF60, Poly(U)-binding-splicing factor PUF60, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUF60Q9UHX1 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PUF60Q9UHX1 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PUF60Q9UHX1 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PUF60Q9UHX1 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PUF60Q9UHX1 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PUF60Q9UHX1 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PUF60Q9UHX1 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PUF60Q9UHX1 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PUF60Q9UHX1 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PUF60Q9UHX1 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PUF60Q9UHX1 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PUF60Q9UHX1 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PUF60Q9UHX1 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PUF60Q9UHX1 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PUF60Q9UHX1 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PUF60Q9UHX1 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PUF60Q9UHX1 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PUF60Q9UHX1 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PUF60Q9UHX1 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PUF60Q9UHX1 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PUF60Q9UHX1 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PUF60Q9UHX1 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PUF60Q9UHX1 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PUF60Q9UHX1 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PUF60Q9UHX1 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PUF60Q9UHX1 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PUF60Q9UHX1 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PUF60Q9UHX1 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PUF60Q9UHX1 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PUF60Q9UHX1 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PUF60Q9UHX1 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PUF60Q9UHX1 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PUF60Q9UHX1 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PUF60Q9UHX1 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PUF60Q9UHX1 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PUF60Q9UHX1 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PUF60Q9UHX1 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PUF60Q9UHX1 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PUF60Q9UHX1 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PUF60Q9UHX1 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PUF60Q9UHX1 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PUF60Q9UHX1 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PUF60Q9UHX1 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PUF60Q9UHX1 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PUF60Q9UHX1 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PUF60Q9UHX1 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PUF60Q9UHX1 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PUF60Q9UHX1 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PUF60Q9UHX1 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PUF60Q9UHX1 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PUF60Q9UHX1 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PUF60Q9UHX1 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PUF60Q9UHX1 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PUF60Q9UHX1 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PUF60Q9UHX1 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PUF60Q9UHX1 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PUF60Q9UHX1 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PUF60Q9UHX1 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
PUF60Q9UHX1 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PUF60Q9UHX1 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PUF60Q9UHX1 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PUF60Q9UHX1 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PUF60Q9UHX1 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PUF60Q9UHX1 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PUF60Q9UHX1 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PUF60Q9UHX1 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PUF60Q9UHX1 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PUF60Q9UHX1 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PUF60Q9UHX1 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
PUF60Q9UHX1 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PUF60Q9UHX1 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PUF60Q9UHX1 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PUF60Q9UHX1 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PUF60Q9UHX1 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PUF60Q9UHX1 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PUF60Q9UHX1 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PUF60Q9UHX1 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PUF60Q9UHX1 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PUF60Q9UHX1 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PUF60Q9UHX1 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PUF60Q9UHX1 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PUF60Q9UHX1 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PUF60Q9UHX1 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PUF60Q9UHX1 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PUF60Q9UHX1 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PUF60Q9UHX1 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PUF60Q9UHX1 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PUF60Q9UHX1 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PUF60Q9UHX1 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PUF60Q9UHX1 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PUF60Q9UHX1 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PUF60Q9UHX1 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PUF60Q9UHX1 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PUF60Q9UHX1 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PUF60Q9UHX1 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PUF60Q9UHX1 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PUF60Q9UHX1 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PUF60Q9UHX1 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PUF60Q9UHX1 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PUF60Q9UHX1 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms