Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHL9

GTF2IRD1, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 959 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2IRD1Q9UHL9 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GTF2IRD1Q9UHL9 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GTF2IRD1Q9UHL9 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GTF2IRD1Q9UHL9 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GTF2IRD1Q9UHL9 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GTF2IRD1Q9UHL9 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GTF2IRD1Q9UHL9 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GTF2IRD1Q9UHL9 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GTF2IRD1Q9UHL9 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GTF2IRD1Q9UHL9 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
GTF2IRD1Q9UHL9 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GTF2IRD1Q9UHL9 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GTF2IRD1Q9UHL9 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GTF2IRD1Q9UHL9 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GTF2IRD1Q9UHL9 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GTF2IRD1Q9UHL9 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GTF2IRD1Q9UHL9 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GTF2IRD1Q9UHL9 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GTF2IRD1Q9UHL9 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GTF2IRD1Q9UHL9 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GTF2IRD1Q9UHL9 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GTF2IRD1Q9UHL9 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GTF2IRD1Q9UHL9 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GTF2IRD1Q9UHL9 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GTF2IRD1Q9UHL9 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
GTF2IRD1Q9UHL9 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GTF2IRD1Q9UHL9 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GTF2IRD1Q9UHL9 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GTF2IRD1Q9UHL9 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GTF2IRD1Q9UHL9 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GTF2IRD1Q9UHL9 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
GTF2IRD1Q9UHL9 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GTF2IRD1Q9UHL9 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GTF2IRD1Q9UHL9 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GTF2IRD1Q9UHL9 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GTF2IRD1Q9UHL9 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GTF2IRD1Q9UHL9 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GTF2IRD1Q9UHL9 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GTF2IRD1Q9UHL9 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GTF2IRD1Q9UHL9 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GTF2IRD1Q9UHL9 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GTF2IRD1Q9UHL9 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GTF2IRD1Q9UHL9 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
GTF2IRD1Q9UHL9 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GTF2IRD1Q9UHL9 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
GTF2IRD1Q9UHL9 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GTF2IRD1Q9UHL9 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GTF2IRD1Q9UHL9 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
GTF2IRD1Q9UHL9 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GTF2IRD1Q9UHL9 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GTF2IRD1Q9UHL9 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GTF2IRD1Q9UHL9 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GTF2IRD1Q9UHL9 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GTF2IRD1Q9UHL9 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GTF2IRD1Q9UHL9 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GTF2IRD1Q9UHL9 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GTF2IRD1Q9UHL9 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GTF2IRD1Q9UHL9 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GTF2IRD1Q9UHL9 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GTF2IRD1Q9UHL9 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GTF2IRD1Q9UHL9 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GTF2IRD1Q9UHL9 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GTF2IRD1Q9UHL9 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GTF2IRD1Q9UHL9 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GTF2IRD1Q9UHL9 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GTF2IRD1Q9UHL9 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GTF2IRD1Q9UHL9 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GTF2IRD1Q9UHL9 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GTF2IRD1Q9UHL9 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
GTF2IRD1Q9UHL9 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GTF2IRD1Q9UHL9 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GTF2IRD1Q9UHL9 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GTF2IRD1Q9UHL9 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GTF2IRD1Q9UHL9 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GTF2IRD1Q9UHL9 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GTF2IRD1Q9UHL9 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GTF2IRD1Q9UHL9 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GTF2IRD1Q9UHL9 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GTF2IRD1Q9UHL9 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GTF2IRD1Q9UHL9 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GTF2IRD1Q9UHL9 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GTF2IRD1Q9UHL9 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GTF2IRD1Q9UHL9 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GTF2IRD1Q9UHL9 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GTF2IRD1Q9UHL9 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GTF2IRD1Q9UHL9 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
GTF2IRD1Q9UHL9 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GTF2IRD1Q9UHL9 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
GTF2IRD1Q9UHL9 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GTF2IRD1Q9UHL9 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GTF2IRD1Q9UHL9 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GTF2IRD1Q9UHL9 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GTF2IRD1Q9UHL9 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
GTF2IRD1Q9UHL9 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
GTF2IRD1Q9UHL9 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
GTF2IRD1Q9UHL9 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
GTF2IRD1Q9UHL9 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GTF2IRD1Q9UHL9 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GTF2IRD1Q9UHL9 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GTF2IRD1Q9UHL9 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms