Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFF9

CNOT8, CCR4-NOT transcription complex subunit 8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT8Q9UFF9 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNOT8Q9UFF9 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNOT8Q9UFF9 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNOT8Q9UFF9 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNOT8Q9UFF9 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNOT8Q9UFF9 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNOT8Q9UFF9 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNOT8Q9UFF9 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNOT8Q9UFF9 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNOT8Q9UFF9 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNOT8Q9UFF9 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNOT8Q9UFF9 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNOT8Q9UFF9 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNOT8Q9UFF9 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNOT8Q9UFF9 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNOT8Q9UFF9 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNOT8Q9UFF9 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNOT8Q9UFF9 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNOT8Q9UFF9 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNOT8Q9UFF9 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNOT8Q9UFF9 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNOT8Q9UFF9 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNOT8Q9UFF9 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNOT8Q9UFF9 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNOT8Q9UFF9 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNOT8Q9UFF9 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CNOT8Q9UFF9 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNOT8Q9UFF9 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNOT8Q9UFF9 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNOT8Q9UFF9 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNOT8Q9UFF9 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNOT8Q9UFF9 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNOT8Q9UFF9 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNOT8Q9UFF9 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNOT8Q9UFF9 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNOT8Q9UFF9 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNOT8Q9UFF9 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNOT8Q9UFF9 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNOT8Q9UFF9 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNOT8Q9UFF9 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNOT8Q9UFF9 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNOT8Q9UFF9 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNOT8Q9UFF9 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNOT8Q9UFF9 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNOT8Q9UFF9 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNOT8Q9UFF9 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNOT8Q9UFF9 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNOT8Q9UFF9 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNOT8Q9UFF9 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNOT8Q9UFF9 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CNOT8Q9UFF9 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNOT8Q9UFF9 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNOT8Q9UFF9 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNOT8Q9UFF9 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CNOT8Q9UFF9 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNOT8Q9UFF9 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CNOT8Q9UFF9 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNOT8Q9UFF9 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CNOT8Q9UFF9 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNOT8Q9UFF9 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNOT8Q9UFF9 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNOT8Q9UFF9 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNOT8Q9UFF9 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNOT8Q9UFF9 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CNOT8Q9UFF9 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNOT8Q9UFF9 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNOT8Q9UFF9 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNOT8Q9UFF9 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNOT8Q9UFF9 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNOT8Q9UFF9 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNOT8Q9UFF9 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNOT8Q9UFF9 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNOT8Q9UFF9 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNOT8Q9UFF9 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNOT8Q9UFF9 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNOT8Q9UFF9 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNOT8Q9UFF9 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNOT8Q9UFF9 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNOT8Q9UFF9 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNOT8Q9UFF9 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNOT8Q9UFF9 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNOT8Q9UFF9 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNOT8Q9UFF9 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNOT8Q9UFF9 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNOT8Q9UFF9 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNOT8Q9UFF9 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNOT8Q9UFF9 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNOT8Q9UFF9 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CNOT8Q9UFF9 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CNOT8Q9UFF9 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CNOT8Q9UFF9 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CNOT8Q9UFF9 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CNOT8Q9UFF9 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CNOT8Q9UFF9 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNOT8Q9UFF9 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNOT8Q9UFF9 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CNOT8Q9UFF9 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNOT8Q9UFF9 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNOT8Q9UFF9 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CNOT8Q9UFF9 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms