Protein–RNA interactions for Protein: Q9UEU0

VTI1B, Vesicle transport through interaction with t-SNAREs homolog 1B, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTI1BQ9UEU0 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
VTI1BQ9UEU0 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
VTI1BQ9UEU0 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
VTI1BQ9UEU0 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
VTI1BQ9UEU0 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
VTI1BQ9UEU0 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.87
VTI1BQ9UEU0 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
VTI1BQ9UEU0 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
VTI1BQ9UEU0 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
VTI1BQ9UEU0 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
VTI1BQ9UEU0 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
VTI1BQ9UEU0 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
VTI1BQ9UEU0 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
VTI1BQ9UEU0 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
VTI1BQ9UEU0 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
VTI1BQ9UEU0 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
VTI1BQ9UEU0 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
VTI1BQ9UEU0 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
VTI1BQ9UEU0 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
VTI1BQ9UEU0 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
VTI1BQ9UEU0 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
VTI1BQ9UEU0 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
VTI1BQ9UEU0 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
VTI1BQ9UEU0 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
VTI1BQ9UEU0 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
VTI1BQ9UEU0 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
VTI1BQ9UEU0 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
VTI1BQ9UEU0 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
VTI1BQ9UEU0 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
VTI1BQ9UEU0 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
VTI1BQ9UEU0 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
VTI1BQ9UEU0 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
VTI1BQ9UEU0 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
VTI1BQ9UEU0 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
VTI1BQ9UEU0 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
VTI1BQ9UEU0 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
VTI1BQ9UEU0 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
VTI1BQ9UEU0 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
VTI1BQ9UEU0 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
VTI1BQ9UEU0 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
VTI1BQ9UEU0 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
VTI1BQ9UEU0 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
VTI1BQ9UEU0 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
VTI1BQ9UEU0 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
VTI1BQ9UEU0 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
VTI1BQ9UEU0 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
VTI1BQ9UEU0 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
VTI1BQ9UEU0 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
VTI1BQ9UEU0 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
VTI1BQ9UEU0 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
VTI1BQ9UEU0 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
VTI1BQ9UEU0 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
VTI1BQ9UEU0 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
VTI1BQ9UEU0 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
VTI1BQ9UEU0 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
VTI1BQ9UEU0 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
VTI1BQ9UEU0 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
VTI1BQ9UEU0 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
VTI1BQ9UEU0 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
VTI1BQ9UEU0 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
VTI1BQ9UEU0 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
VTI1BQ9UEU0 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
VTI1BQ9UEU0 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
VTI1BQ9UEU0 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
VTI1BQ9UEU0 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
VTI1BQ9UEU0 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VTI1BQ9UEU0 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VTI1BQ9UEU0 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VTI1BQ9UEU0 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
VTI1BQ9UEU0 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VTI1BQ9UEU0 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VTI1BQ9UEU0 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
VTI1BQ9UEU0 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VTI1BQ9UEU0 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
VTI1BQ9UEU0 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
VTI1BQ9UEU0 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VTI1BQ9UEU0 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VTI1BQ9UEU0 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
VTI1BQ9UEU0 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VTI1BQ9UEU0 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
VTI1BQ9UEU0 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VTI1BQ9UEU0 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
VTI1BQ9UEU0 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VTI1BQ9UEU0 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VTI1BQ9UEU0 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
VTI1BQ9UEU0 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
VTI1BQ9UEU0 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VTI1BQ9UEU0 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
VTI1BQ9UEU0 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
VTI1BQ9UEU0 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
VTI1BQ9UEU0 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
VTI1BQ9UEU0 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
VTI1BQ9UEU0 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
VTI1BQ9UEU0 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
VTI1BQ9UEU0 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VTI1BQ9UEU0 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
VTI1BQ9UEU0 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
VTI1BQ9UEU0 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
VTI1BQ9UEU0 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
VTI1BQ9UEU0 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms