Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBX2

DUX4, Double homeobox protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX4Q9UBX2 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
DUX4Q9UBX2 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
DUX4Q9UBX2 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DUX4Q9UBX2 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DUX4Q9UBX2 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DUX4Q9UBX2 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DUX4Q9UBX2 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DUX4Q9UBX2 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DUX4Q9UBX2 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DUX4Q9UBX2 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DUX4Q9UBX2 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DUX4Q9UBX2 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DUX4Q9UBX2 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DUX4Q9UBX2 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DUX4Q9UBX2 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DUX4Q9UBX2 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
DUX4Q9UBX2 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
DUX4Q9UBX2 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DUX4Q9UBX2 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DUX4Q9UBX2 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
DUX4Q9UBX2 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DUX4Q9UBX2 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
DUX4Q9UBX2 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DUX4Q9UBX2 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DUX4Q9UBX2 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DUX4Q9UBX2 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DUX4Q9UBX2 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DUX4Q9UBX2 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DUX4Q9UBX2 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DUX4Q9UBX2 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DUX4Q9UBX2 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DUX4Q9UBX2 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DUX4Q9UBX2 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
DUX4Q9UBX2 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DUX4Q9UBX2 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DUX4Q9UBX2 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DUX4Q9UBX2 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DUX4Q9UBX2 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DUX4Q9UBX2 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
DUX4Q9UBX2 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
DUX4Q9UBX2 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DUX4Q9UBX2 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DUX4Q9UBX2 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DUX4Q9UBX2 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DUX4Q9UBX2 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
DUX4Q9UBX2 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DUX4Q9UBX2 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
DUX4Q9UBX2 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DUX4Q9UBX2 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DUX4Q9UBX2 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
DUX4Q9UBX2 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DUX4Q9UBX2 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DUX4Q9UBX2 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DUX4Q9UBX2 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DUX4Q9UBX2 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DUX4Q9UBX2 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
DUX4Q9UBX2 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DUX4Q9UBX2 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DUX4Q9UBX2 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DUX4Q9UBX2 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DUX4Q9UBX2 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DUX4Q9UBX2 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DUX4Q9UBX2 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DUX4Q9UBX2 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DUX4Q9UBX2 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DUX4Q9UBX2 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DUX4Q9UBX2 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DUX4Q9UBX2 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DUX4Q9UBX2 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DUX4Q9UBX2 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DUX4Q9UBX2 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DUX4Q9UBX2 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DUX4Q9UBX2 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
DUX4Q9UBX2 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
DUX4Q9UBX2 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DUX4Q9UBX2 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DUX4Q9UBX2 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DUX4Q9UBX2 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DUX4Q9UBX2 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
DUX4Q9UBX2 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DUX4Q9UBX2 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DUX4Q9UBX2 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DUX4Q9UBX2 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DUX4Q9UBX2 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DUX4Q9UBX2 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DUX4Q9UBX2 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DUX4Q9UBX2 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DUX4Q9UBX2 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DUX4Q9UBX2 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DUX4Q9UBX2 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DUX4Q9UBX2 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DUX4Q9UBX2 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
DUX4Q9UBX2 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DUX4Q9UBX2 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
DUX4Q9UBX2 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
DUX4Q9UBX2 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DUX4Q9UBX2 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DUX4Q9UBX2 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DUX4Q9UBX2 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DUX4Q9UBX2 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms