Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP0

SPAST, Spastin, humanhuman

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPASTQ9UBP0 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SPASTQ9UBP0 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SPASTQ9UBP0 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SPASTQ9UBP0 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SPASTQ9UBP0 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SPASTQ9UBP0 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SPASTQ9UBP0 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SPASTQ9UBP0 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SPASTQ9UBP0 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SPASTQ9UBP0 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SPASTQ9UBP0 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SPASTQ9UBP0 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SPASTQ9UBP0 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SPASTQ9UBP0 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
SPASTQ9UBP0 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SPASTQ9UBP0 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SPASTQ9UBP0 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SPASTQ9UBP0 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SPASTQ9UBP0 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SPASTQ9UBP0 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
SPASTQ9UBP0 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SPASTQ9UBP0 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SPASTQ9UBP0 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SPASTQ9UBP0 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SPASTQ9UBP0 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SPASTQ9UBP0 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
SPASTQ9UBP0 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
SPASTQ9UBP0 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SPASTQ9UBP0 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SPASTQ9UBP0 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SPASTQ9UBP0 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SPASTQ9UBP0 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SPASTQ9UBP0 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SPASTQ9UBP0 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SPASTQ9UBP0 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SPASTQ9UBP0 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SPASTQ9UBP0 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SPASTQ9UBP0 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SPASTQ9UBP0 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SPASTQ9UBP0 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SPASTQ9UBP0 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SPASTQ9UBP0 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SPASTQ9UBP0 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SPASTQ9UBP0 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SPASTQ9UBP0 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SPASTQ9UBP0 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SPASTQ9UBP0 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SPASTQ9UBP0 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
SPASTQ9UBP0 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SPASTQ9UBP0 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SPASTQ9UBP0 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SPASTQ9UBP0 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SPASTQ9UBP0 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SPASTQ9UBP0 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SPASTQ9UBP0 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SPASTQ9UBP0 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SPASTQ9UBP0 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SPASTQ9UBP0 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SPASTQ9UBP0 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SPASTQ9UBP0 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SPASTQ9UBP0 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SPASTQ9UBP0 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SPASTQ9UBP0 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SPASTQ9UBP0 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SPASTQ9UBP0 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SPASTQ9UBP0 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SPASTQ9UBP0 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SPASTQ9UBP0 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SPASTQ9UBP0 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SPASTQ9UBP0 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SPASTQ9UBP0 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SPASTQ9UBP0 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
SPASTQ9UBP0 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SPASTQ9UBP0 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SPASTQ9UBP0 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
SPASTQ9UBP0 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SPASTQ9UBP0 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SPASTQ9UBP0 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SPASTQ9UBP0 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SPASTQ9UBP0 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SPASTQ9UBP0 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SPASTQ9UBP0 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SPASTQ9UBP0 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SPASTQ9UBP0 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
SPASTQ9UBP0 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SPASTQ9UBP0 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SPASTQ9UBP0 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SPASTQ9UBP0 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SPASTQ9UBP0 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SPASTQ9UBP0 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SPASTQ9UBP0 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
SPASTQ9UBP0 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SPASTQ9UBP0 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SPASTQ9UBP0 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SPASTQ9UBP0 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SPASTQ9UBP0 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SPASTQ9UBP0 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
SPASTQ9UBP0 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SPASTQ9UBP0 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SPASTQ9UBP0 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms