Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN1

CACNG4, Voltage-dependent calcium channel gamma-4 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG4Q9UBN1 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CACNG4Q9UBN1 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CACNG4Q9UBN1 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CACNG4Q9UBN1 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CACNG4Q9UBN1 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CACNG4Q9UBN1 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CACNG4Q9UBN1 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CACNG4Q9UBN1 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CACNG4Q9UBN1 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CACNG4Q9UBN1 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CACNG4Q9UBN1 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CACNG4Q9UBN1 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CACNG4Q9UBN1 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CACNG4Q9UBN1 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CACNG4Q9UBN1 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CACNG4Q9UBN1 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CACNG4Q9UBN1 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CACNG4Q9UBN1 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CACNG4Q9UBN1 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CACNG4Q9UBN1 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CACNG4Q9UBN1 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CACNG4Q9UBN1 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CACNG4Q9UBN1 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CACNG4Q9UBN1 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CACNG4Q9UBN1 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CACNG4Q9UBN1 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CACNG4Q9UBN1 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CACNG4Q9UBN1 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CACNG4Q9UBN1 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CACNG4Q9UBN1 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CACNG4Q9UBN1 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CACNG4Q9UBN1 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CACNG4Q9UBN1 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CACNG4Q9UBN1 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CACNG4Q9UBN1 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CACNG4Q9UBN1 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CACNG4Q9UBN1 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CACNG4Q9UBN1 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CACNG4Q9UBN1 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CACNG4Q9UBN1 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CACNG4Q9UBN1 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CACNG4Q9UBN1 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CACNG4Q9UBN1 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CACNG4Q9UBN1 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CACNG4Q9UBN1 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CACNG4Q9UBN1 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CACNG4Q9UBN1 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CACNG4Q9UBN1 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CACNG4Q9UBN1 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CACNG4Q9UBN1 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CACNG4Q9UBN1 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CACNG4Q9UBN1 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CACNG4Q9UBN1 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CACNG4Q9UBN1 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CACNG4Q9UBN1 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CACNG4Q9UBN1 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CACNG4Q9UBN1 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CACNG4Q9UBN1 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CACNG4Q9UBN1 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CACNG4Q9UBN1 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CACNG4Q9UBN1 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CACNG4Q9UBN1 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CACNG4Q9UBN1 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CACNG4Q9UBN1 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CACNG4Q9UBN1 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CACNG4Q9UBN1 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CACNG4Q9UBN1 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CACNG4Q9UBN1 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CACNG4Q9UBN1 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CACNG4Q9UBN1 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CACNG4Q9UBN1 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CACNG4Q9UBN1 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CACNG4Q9UBN1 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CACNG4Q9UBN1 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CACNG4Q9UBN1 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CACNG4Q9UBN1 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CACNG4Q9UBN1 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CACNG4Q9UBN1 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CACNG4Q9UBN1 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CACNG4Q9UBN1 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CACNG4Q9UBN1 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CACNG4Q9UBN1 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CACNG4Q9UBN1 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CACNG4Q9UBN1 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CACNG4Q9UBN1 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CACNG4Q9UBN1 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CACNG4Q9UBN1 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CACNG4Q9UBN1 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CACNG4Q9UBN1 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CACNG4Q9UBN1 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CACNG4Q9UBN1 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CACNG4Q9UBN1 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CACNG4Q9UBN1 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CACNG4Q9UBN1 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CACNG4Q9UBN1 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CACNG4Q9UBN1 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CACNG4Q9UBN1 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CACNG4Q9UBN1 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CACNG4Q9UBN1 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CACNG4Q9UBN1 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms