Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBE0

SAE1, SUMO-activating enzyme subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAE1Q9UBE0 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SAE1Q9UBE0 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SAE1Q9UBE0 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SAE1Q9UBE0 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SAE1Q9UBE0 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SAE1Q9UBE0 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SAE1Q9UBE0 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SAE1Q9UBE0 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SAE1Q9UBE0 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SAE1Q9UBE0 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SAE1Q9UBE0 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SAE1Q9UBE0 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SAE1Q9UBE0 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SAE1Q9UBE0 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SAE1Q9UBE0 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SAE1Q9UBE0 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SAE1Q9UBE0 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SAE1Q9UBE0 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SAE1Q9UBE0 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SAE1Q9UBE0 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SAE1Q9UBE0 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SAE1Q9UBE0 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SAE1Q9UBE0 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SAE1Q9UBE0 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SAE1Q9UBE0 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SAE1Q9UBE0 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SAE1Q9UBE0 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SAE1Q9UBE0 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SAE1Q9UBE0 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SAE1Q9UBE0 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SAE1Q9UBE0 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SAE1Q9UBE0 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SAE1Q9UBE0 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SAE1Q9UBE0 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SAE1Q9UBE0 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SAE1Q9UBE0 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SAE1Q9UBE0 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SAE1Q9UBE0 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SAE1Q9UBE0 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SAE1Q9UBE0 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SAE1Q9UBE0 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SAE1Q9UBE0 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SAE1Q9UBE0 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SAE1Q9UBE0 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SAE1Q9UBE0 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SAE1Q9UBE0 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SAE1Q9UBE0 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SAE1Q9UBE0 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SAE1Q9UBE0 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SAE1Q9UBE0 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SAE1Q9UBE0 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SAE1Q9UBE0 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SAE1Q9UBE0 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SAE1Q9UBE0 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SAE1Q9UBE0 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SAE1Q9UBE0 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SAE1Q9UBE0 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SAE1Q9UBE0 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SAE1Q9UBE0 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SAE1Q9UBE0 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SAE1Q9UBE0 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SAE1Q9UBE0 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SAE1Q9UBE0 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SAE1Q9UBE0 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SAE1Q9UBE0 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SAE1Q9UBE0 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SAE1Q9UBE0 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SAE1Q9UBE0 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SAE1Q9UBE0 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SAE1Q9UBE0 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SAE1Q9UBE0 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SAE1Q9UBE0 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SAE1Q9UBE0 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SAE1Q9UBE0 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SAE1Q9UBE0 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SAE1Q9UBE0 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SAE1Q9UBE0 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SAE1Q9UBE0 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SAE1Q9UBE0 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SAE1Q9UBE0 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SAE1Q9UBE0 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
SAE1Q9UBE0 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SAE1Q9UBE0 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SAE1Q9UBE0 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SAE1Q9UBE0 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SAE1Q9UBE0 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SAE1Q9UBE0 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SAE1Q9UBE0 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SAE1Q9UBE0 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SAE1Q9UBE0 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SAE1Q9UBE0 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SAE1Q9UBE0 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SAE1Q9UBE0 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SAE1Q9UBE0 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SAE1Q9UBE0 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SAE1Q9UBE0 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SAE1Q9UBE0 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
SAE1Q9UBE0 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SAE1Q9UBE0 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SAE1Q9UBE0 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms