Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBB5

MBD2, Methyl-CpG-binding domain protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD2Q9UBB5 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MBD2Q9UBB5 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MBD2Q9UBB5 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MBD2Q9UBB5 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MBD2Q9UBB5 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MBD2Q9UBB5 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MBD2Q9UBB5 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MBD2Q9UBB5 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MBD2Q9UBB5 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MBD2Q9UBB5 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MBD2Q9UBB5 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MBD2Q9UBB5 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MBD2Q9UBB5 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MBD2Q9UBB5 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MBD2Q9UBB5 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MBD2Q9UBB5 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MBD2Q9UBB5 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MBD2Q9UBB5 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MBD2Q9UBB5 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MBD2Q9UBB5 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MBD2Q9UBB5 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MBD2Q9UBB5 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
MBD2Q9UBB5 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MBD2Q9UBB5 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MBD2Q9UBB5 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
MBD2Q9UBB5 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MBD2Q9UBB5 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MBD2Q9UBB5 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MBD2Q9UBB5 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MBD2Q9UBB5 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MBD2Q9UBB5 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MBD2Q9UBB5 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MBD2Q9UBB5 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MBD2Q9UBB5 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MBD2Q9UBB5 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MBD2Q9UBB5 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MBD2Q9UBB5 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MBD2Q9UBB5 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MBD2Q9UBB5 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MBD2Q9UBB5 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MBD2Q9UBB5 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MBD2Q9UBB5 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MBD2Q9UBB5 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MBD2Q9UBB5 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
MBD2Q9UBB5 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
MBD2Q9UBB5 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
MBD2Q9UBB5 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
MBD2Q9UBB5 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MBD2Q9UBB5 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MBD2Q9UBB5 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MBD2Q9UBB5 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MBD2Q9UBB5 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MBD2Q9UBB5 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MBD2Q9UBB5 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MBD2Q9UBB5 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MBD2Q9UBB5 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MBD2Q9UBB5 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MBD2Q9UBB5 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MBD2Q9UBB5 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
MBD2Q9UBB5 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MBD2Q9UBB5 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
MBD2Q9UBB5 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MBD2Q9UBB5 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MBD2Q9UBB5 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MBD2Q9UBB5 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MBD2Q9UBB5 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
MBD2Q9UBB5 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
MBD2Q9UBB5 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MBD2Q9UBB5 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MBD2Q9UBB5 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MBD2Q9UBB5 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MBD2Q9UBB5 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MBD2Q9UBB5 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MBD2Q9UBB5 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MBD2Q9UBB5 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MBD2Q9UBB5 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MBD2Q9UBB5 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MBD2Q9UBB5 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MBD2Q9UBB5 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MBD2Q9UBB5 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MBD2Q9UBB5 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MBD2Q9UBB5 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MBD2Q9UBB5 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MBD2Q9UBB5 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MBD2Q9UBB5 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MBD2Q9UBB5 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
MBD2Q9UBB5 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
MBD2Q9UBB5 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MBD2Q9UBB5 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MBD2Q9UBB5 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MBD2Q9UBB5 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MBD2Q9UBB5 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MBD2Q9UBB5 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MBD2Q9UBB5 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MBD2Q9UBB5 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MBD2Q9UBB5 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
MBD2Q9UBB5 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MBD2Q9UBB5 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MBD2Q9UBB5 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
MBD2Q9UBB5 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms