Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYV4

CDK12, Cyclin-dependent kinase 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK12Q9NYV4 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CDK12Q9NYV4 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CDK12Q9NYV4 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CDK12Q9NYV4 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CDK12Q9NYV4 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CDK12Q9NYV4 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CDK12Q9NYV4 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
CDK12Q9NYV4 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
CDK12Q9NYV4 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CDK12Q9NYV4 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CDK12Q9NYV4 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CDK12Q9NYV4 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CDK12Q9NYV4 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CDK12Q9NYV4 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CDK12Q9NYV4 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CDK12Q9NYV4 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CDK12Q9NYV4 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CDK12Q9NYV4 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CDK12Q9NYV4 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CDK12Q9NYV4 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CDK12Q9NYV4 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CDK12Q9NYV4 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CDK12Q9NYV4 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CDK12Q9NYV4 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CDK12Q9NYV4 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CDK12Q9NYV4 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CDK12Q9NYV4 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
CDK12Q9NYV4 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CDK12Q9NYV4 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
CDK12Q9NYV4 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CDK12Q9NYV4 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CDK12Q9NYV4 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CDK12Q9NYV4 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CDK12Q9NYV4 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CDK12Q9NYV4 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CDK12Q9NYV4 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CDK12Q9NYV4 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CDK12Q9NYV4 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CDK12Q9NYV4 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CDK12Q9NYV4 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CDK12Q9NYV4 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CDK12Q9NYV4 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
CDK12Q9NYV4 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
CDK12Q9NYV4 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
CDK12Q9NYV4 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC28.64■■■□□ 2.17
CDK12Q9NYV4 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC28.64■■■□□ 2.17
CDK12Q9NYV4 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.17
CDK12Q9NYV4 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC28.64■■■□□ 2.17
CDK12Q9NYV4 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC28.64■■■□□ 2.17
CDK12Q9NYV4 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CDK12Q9NYV4 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CDK12Q9NYV4 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CDK12Q9NYV4 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CDK12Q9NYV4 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CDK12Q9NYV4 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CDK12Q9NYV4 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CDK12Q9NYV4 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CDK12Q9NYV4 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CDK12Q9NYV4 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CDK12Q9NYV4 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
CDK12Q9NYV4 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CDK12Q9NYV4 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CDK12Q9NYV4 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
CDK12Q9NYV4 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CDK12Q9NYV4 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CDK12Q9NYV4 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CDK12Q9NYV4 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CDK12Q9NYV4 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CDK12Q9NYV4 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CDK12Q9NYV4 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CDK12Q9NYV4 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CDK12Q9NYV4 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CDK12Q9NYV4 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CDK12Q9NYV4 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CDK12Q9NYV4 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CDK12Q9NYV4 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CDK12Q9NYV4 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CDK12Q9NYV4 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
CDK12Q9NYV4 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CDK12Q9NYV4 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CDK12Q9NYV4 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
CDK12Q9NYV4 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CDK12Q9NYV4 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CDK12Q9NYV4 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CDK12Q9NYV4 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CDK12Q9NYV4 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CDK12Q9NYV4 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CDK12Q9NYV4 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CDK12Q9NYV4 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CDK12Q9NYV4 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CDK12Q9NYV4 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CDK12Q9NYV4 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CDK12Q9NYV4 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
CDK12Q9NYV4 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CDK12Q9NYV4 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CDK12Q9NYV4 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CDK12Q9NYV4 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CDK12Q9NYV4 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
CDK12Q9NYV4 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CDK12Q9NYV4 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms