Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXN4

GDAP2, Ganglioside-induced differentiation-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDAP2Q9NXN4 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GDAP2Q9NXN4 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GDAP2Q9NXN4 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GDAP2Q9NXN4 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GDAP2Q9NXN4 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GDAP2Q9NXN4 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GDAP2Q9NXN4 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GDAP2Q9NXN4 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GDAP2Q9NXN4 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GDAP2Q9NXN4 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GDAP2Q9NXN4 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GDAP2Q9NXN4 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GDAP2Q9NXN4 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GDAP2Q9NXN4 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GDAP2Q9NXN4 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GDAP2Q9NXN4 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GDAP2Q9NXN4 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GDAP2Q9NXN4 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GDAP2Q9NXN4 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GDAP2Q9NXN4 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GDAP2Q9NXN4 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GDAP2Q9NXN4 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GDAP2Q9NXN4 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GDAP2Q9NXN4 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GDAP2Q9NXN4 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GDAP2Q9NXN4 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GDAP2Q9NXN4 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GDAP2Q9NXN4 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GDAP2Q9NXN4 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GDAP2Q9NXN4 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GDAP2Q9NXN4 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GDAP2Q9NXN4 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GDAP2Q9NXN4 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GDAP2Q9NXN4 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GDAP2Q9NXN4 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GDAP2Q9NXN4 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GDAP2Q9NXN4 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GDAP2Q9NXN4 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GDAP2Q9NXN4 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GDAP2Q9NXN4 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GDAP2Q9NXN4 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GDAP2Q9NXN4 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GDAP2Q9NXN4 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GDAP2Q9NXN4 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GDAP2Q9NXN4 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GDAP2Q9NXN4 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
GDAP2Q9NXN4 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GDAP2Q9NXN4 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
GDAP2Q9NXN4 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GDAP2Q9NXN4 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GDAP2Q9NXN4 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GDAP2Q9NXN4 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
GDAP2Q9NXN4 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GDAP2Q9NXN4 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GDAP2Q9NXN4 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GDAP2Q9NXN4 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GDAP2Q9NXN4 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GDAP2Q9NXN4 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GDAP2Q9NXN4 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GDAP2Q9NXN4 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GDAP2Q9NXN4 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
GDAP2Q9NXN4 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GDAP2Q9NXN4 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GDAP2Q9NXN4 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GDAP2Q9NXN4 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
GDAP2Q9NXN4 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GDAP2Q9NXN4 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GDAP2Q9NXN4 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GDAP2Q9NXN4 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GDAP2Q9NXN4 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GDAP2Q9NXN4 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GDAP2Q9NXN4 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
GDAP2Q9NXN4 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
GDAP2Q9NXN4 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
GDAP2Q9NXN4 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GDAP2Q9NXN4 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GDAP2Q9NXN4 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GDAP2Q9NXN4 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GDAP2Q9NXN4 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GDAP2Q9NXN4 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GDAP2Q9NXN4 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GDAP2Q9NXN4 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GDAP2Q9NXN4 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GDAP2Q9NXN4 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GDAP2Q9NXN4 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GDAP2Q9NXN4 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GDAP2Q9NXN4 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GDAP2Q9NXN4 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GDAP2Q9NXN4 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GDAP2Q9NXN4 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
GDAP2Q9NXN4 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
GDAP2Q9NXN4 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GDAP2Q9NXN4 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GDAP2Q9NXN4 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GDAP2Q9NXN4 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GDAP2Q9NXN4 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GDAP2Q9NXN4 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GDAP2Q9NXN4 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GDAP2Q9NXN4 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GDAP2Q9NXN4 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.7 ms