Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXC5

MIOS, GATOR complex protein MIOS, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIOSQ9NXC5 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MIOSQ9NXC5 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
MIOSQ9NXC5 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
MIOSQ9NXC5 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
MIOSQ9NXC5 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MIOSQ9NXC5 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MIOSQ9NXC5 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MIOSQ9NXC5 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MIOSQ9NXC5 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MIOSQ9NXC5 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MIOSQ9NXC5 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MIOSQ9NXC5 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MIOSQ9NXC5 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
MIOSQ9NXC5 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
MIOSQ9NXC5 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MIOSQ9NXC5 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MIOSQ9NXC5 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MIOSQ9NXC5 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MIOSQ9NXC5 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
MIOSQ9NXC5 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
MIOSQ9NXC5 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MIOSQ9NXC5 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MIOSQ9NXC5 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MIOSQ9NXC5 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MIOSQ9NXC5 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MIOSQ9NXC5 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MIOSQ9NXC5 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MIOSQ9NXC5 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MIOSQ9NXC5 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
MIOSQ9NXC5 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MIOSQ9NXC5 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MIOSQ9NXC5 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
MIOSQ9NXC5 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
MIOSQ9NXC5 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
MIOSQ9NXC5 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MIOSQ9NXC5 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MIOSQ9NXC5 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MIOSQ9NXC5 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MIOSQ9NXC5 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MIOSQ9NXC5 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MIOSQ9NXC5 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MIOSQ9NXC5 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MIOSQ9NXC5 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
MIOSQ9NXC5 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
MIOSQ9NXC5 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MIOSQ9NXC5 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
MIOSQ9NXC5 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MIOSQ9NXC5 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MIOSQ9NXC5 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MIOSQ9NXC5 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MIOSQ9NXC5 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MIOSQ9NXC5 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MIOSQ9NXC5 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MIOSQ9NXC5 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MIOSQ9NXC5 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
MIOSQ9NXC5 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MIOSQ9NXC5 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MIOSQ9NXC5 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MIOSQ9NXC5 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MIOSQ9NXC5 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MIOSQ9NXC5 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
MIOSQ9NXC5 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
MIOSQ9NXC5 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MIOSQ9NXC5 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MIOSQ9NXC5 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MIOSQ9NXC5 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MIOSQ9NXC5 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MIOSQ9NXC5 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MIOSQ9NXC5 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MIOSQ9NXC5 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MIOSQ9NXC5 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
MIOSQ9NXC5 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
MIOSQ9NXC5 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MIOSQ9NXC5 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
MIOSQ9NXC5 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
MIOSQ9NXC5 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MIOSQ9NXC5 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MIOSQ9NXC5 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
MIOSQ9NXC5 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MIOSQ9NXC5 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MIOSQ9NXC5 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MIOSQ9NXC5 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MIOSQ9NXC5 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MIOSQ9NXC5 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MIOSQ9NXC5 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MIOSQ9NXC5 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MIOSQ9NXC5 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MIOSQ9NXC5 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MIOSQ9NXC5 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MIOSQ9NXC5 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MIOSQ9NXC5 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MIOSQ9NXC5 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MIOSQ9NXC5 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MIOSQ9NXC5 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MIOSQ9NXC5 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
MIOSQ9NXC5 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MIOSQ9NXC5 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MIOSQ9NXC5 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MIOSQ9NXC5 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MIOSQ9NXC5 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms