Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX36

DNAJC28, DnaJ homolog subfamily C member 28, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC28Q9NX36 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC21.18■□□□□ 0.98
DNAJC28Q9NX36 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DNAJC28Q9NX36 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DNAJC28Q9NX36 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DNAJC28Q9NX36 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
DNAJC28Q9NX36 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
DNAJC28Q9NX36 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
DNAJC28Q9NX36 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
DNAJC28Q9NX36 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DNAJC28Q9NX36 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DNAJC28Q9NX36 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
DNAJC28Q9NX36 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
DNAJC28Q9NX36 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
DNAJC28Q9NX36 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
DNAJC28Q9NX36 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
DNAJC28Q9NX36 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DNAJC28Q9NX36 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DNAJC28Q9NX36 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DNAJC28Q9NX36 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
DNAJC28Q9NX36 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
DNAJC28Q9NX36 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DNAJC28Q9NX36 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DNAJC28Q9NX36 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
DNAJC28Q9NX36 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
DNAJC28Q9NX36 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
DNAJC28Q9NX36 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
DNAJC28Q9NX36 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
DNAJC28Q9NX36 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
DNAJC28Q9NX36 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
DNAJC28Q9NX36 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
DNAJC28Q9NX36 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
DNAJC28Q9NX36 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
DNAJC28Q9NX36 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
DNAJC28Q9NX36 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
DNAJC28Q9NX36 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
DNAJC28Q9NX36 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
DNAJC28Q9NX36 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
DNAJC28Q9NX36 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
DNAJC28Q9NX36 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
DNAJC28Q9NX36 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
DNAJC28Q9NX36 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DNAJC28Q9NX36 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DNAJC28Q9NX36 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DNAJC28Q9NX36 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DNAJC28Q9NX36 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DNAJC28Q9NX36 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DNAJC28Q9NX36 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DNAJC28Q9NX36 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DNAJC28Q9NX36 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DNAJC28Q9NX36 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DNAJC28Q9NX36 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
DNAJC28Q9NX36 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
DNAJC28Q9NX36 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
DNAJC28Q9NX36 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
DNAJC28Q9NX36 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
DNAJC28Q9NX36 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
DNAJC28Q9NX36 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
DNAJC28Q9NX36 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
DNAJC28Q9NX36 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
DNAJC28Q9NX36 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
DNAJC28Q9NX36 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
DNAJC28Q9NX36 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
DNAJC28Q9NX36 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
DNAJC28Q9NX36 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
DNAJC28Q9NX36 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
DNAJC28Q9NX36 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
DNAJC28Q9NX36 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
DNAJC28Q9NX36 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
DNAJC28Q9NX36 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
DNAJC28Q9NX36 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DNAJC28Q9NX36 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DNAJC28Q9NX36 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DNAJC28Q9NX36 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DNAJC28Q9NX36 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DNAJC28Q9NX36 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DNAJC28Q9NX36 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DNAJC28Q9NX36 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DNAJC28Q9NX36 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DNAJC28Q9NX36 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
DNAJC28Q9NX36 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DNAJC28Q9NX36 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DNAJC28Q9NX36 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
DNAJC28Q9NX36 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
DNAJC28Q9NX36 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DNAJC28Q9NX36 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
DNAJC28Q9NX36 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DNAJC28Q9NX36 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DNAJC28Q9NX36 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DNAJC28Q9NX36 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
DNAJC28Q9NX36 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
DNAJC28Q9NX36 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DNAJC28Q9NX36 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DNAJC28Q9NX36 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
DNAJC28Q9NX36 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
DNAJC28Q9NX36 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DNAJC28Q9NX36 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
DNAJC28Q9NX36 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
DNAJC28Q9NX36 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
DNAJC28Q9NX36 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
DNAJC28Q9NX36 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms