Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVM6

DNAJC17, DnaJ homolog subfamily C member 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC17Q9NVM6 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
DNAJC17Q9NVM6 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DNAJC17Q9NVM6 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DNAJC17Q9NVM6 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DNAJC17Q9NVM6 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DNAJC17Q9NVM6 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DNAJC17Q9NVM6 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DNAJC17Q9NVM6 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DNAJC17Q9NVM6 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DNAJC17Q9NVM6 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DNAJC17Q9NVM6 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DNAJC17Q9NVM6 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DNAJC17Q9NVM6 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DNAJC17Q9NVM6 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DNAJC17Q9NVM6 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DNAJC17Q9NVM6 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DNAJC17Q9NVM6 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DNAJC17Q9NVM6 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DNAJC17Q9NVM6 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DNAJC17Q9NVM6 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DNAJC17Q9NVM6 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DNAJC17Q9NVM6 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DNAJC17Q9NVM6 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DNAJC17Q9NVM6 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
DNAJC17Q9NVM6 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DNAJC17Q9NVM6 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DNAJC17Q9NVM6 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DNAJC17Q9NVM6 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DNAJC17Q9NVM6 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
DNAJC17Q9NVM6 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DNAJC17Q9NVM6 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DNAJC17Q9NVM6 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DNAJC17Q9NVM6 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DNAJC17Q9NVM6 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DNAJC17Q9NVM6 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DNAJC17Q9NVM6 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DNAJC17Q9NVM6 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DNAJC17Q9NVM6 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
DNAJC17Q9NVM6 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DNAJC17Q9NVM6 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DNAJC17Q9NVM6 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DNAJC17Q9NVM6 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DNAJC17Q9NVM6 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DNAJC17Q9NVM6 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DNAJC17Q9NVM6 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DNAJC17Q9NVM6 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DNAJC17Q9NVM6 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DNAJC17Q9NVM6 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DNAJC17Q9NVM6 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
DNAJC17Q9NVM6 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
DNAJC17Q9NVM6 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
DNAJC17Q9NVM6 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DNAJC17Q9NVM6 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DNAJC17Q9NVM6 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
DNAJC17Q9NVM6 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DNAJC17Q9NVM6 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DNAJC17Q9NVM6 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DNAJC17Q9NVM6 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DNAJC17Q9NVM6 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DNAJC17Q9NVM6 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DNAJC17Q9NVM6 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DNAJC17Q9NVM6 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DNAJC17Q9NVM6 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DNAJC17Q9NVM6 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DNAJC17Q9NVM6 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DNAJC17Q9NVM6 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DNAJC17Q9NVM6 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
DNAJC17Q9NVM6 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DNAJC17Q9NVM6 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DNAJC17Q9NVM6 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
DNAJC17Q9NVM6 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DNAJC17Q9NVM6 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DNAJC17Q9NVM6 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DNAJC17Q9NVM6 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
DNAJC17Q9NVM6 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DNAJC17Q9NVM6 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DNAJC17Q9NVM6 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DNAJC17Q9NVM6 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DNAJC17Q9NVM6 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DNAJC17Q9NVM6 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DNAJC17Q9NVM6 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DNAJC17Q9NVM6 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DNAJC17Q9NVM6 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DNAJC17Q9NVM6 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DNAJC17Q9NVM6 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DNAJC17Q9NVM6 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DNAJC17Q9NVM6 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DNAJC17Q9NVM6 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DNAJC17Q9NVM6 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DNAJC17Q9NVM6 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DNAJC17Q9NVM6 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DNAJC17Q9NVM6 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DNAJC17Q9NVM6 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DNAJC17Q9NVM6 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DNAJC17Q9NVM6 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DNAJC17Q9NVM6 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DNAJC17Q9NVM6 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
DNAJC17Q9NVM6 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DNAJC17Q9NVM6 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
DNAJC17Q9NVM6 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms