Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVI1

FANCI, Fanconi anemia group I protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCIQ9NVI1 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
FANCIQ9NVI1 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
FANCIQ9NVI1 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
FANCIQ9NVI1 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
FANCIQ9NVI1 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2
FANCIQ9NVI1 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
FANCIQ9NVI1 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
FANCIQ9NVI1 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
FANCIQ9NVI1 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
FANCIQ9NVI1 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
FANCIQ9NVI1 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
FANCIQ9NVI1 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
FANCIQ9NVI1 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
FANCIQ9NVI1 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
FANCIQ9NVI1 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
FANCIQ9NVI1 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
FANCIQ9NVI1 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
FANCIQ9NVI1 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC27.57■■■□□ 2
FANCIQ9NVI1 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
FANCIQ9NVI1 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
FANCIQ9NVI1 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
FANCIQ9NVI1 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
FANCIQ9NVI1 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
FANCIQ9NVI1 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
FANCIQ9NVI1 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
FANCIQ9NVI1 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
FANCIQ9NVI1 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
FANCIQ9NVI1 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
FANCIQ9NVI1 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
FANCIQ9NVI1 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
FANCIQ9NVI1 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC27.56■■■□□ 2
FANCIQ9NVI1 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
FANCIQ9NVI1 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
FANCIQ9NVI1 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
FANCIQ9NVI1 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
FANCIQ9NVI1 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
FANCIQ9NVI1 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
FANCIQ9NVI1 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
FANCIQ9NVI1 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
FANCIQ9NVI1 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
FANCIQ9NVI1 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
FANCIQ9NVI1 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
FANCIQ9NVI1 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
FANCIQ9NVI1 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
FANCIQ9NVI1 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC27.55■■■□□ 2
FANCIQ9NVI1 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
FANCIQ9NVI1 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC27.55■■■□□ 2
FANCIQ9NVI1 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC27.55■■■□□ 2
FANCIQ9NVI1 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
FANCIQ9NVI1 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
FANCIQ9NVI1 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
FANCIQ9NVI1 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
FANCIQ9NVI1 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
FANCIQ9NVI1 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
FANCIQ9NVI1 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
FANCIQ9NVI1 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
FANCIQ9NVI1 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
FANCIQ9NVI1 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
FANCIQ9NVI1 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
FANCIQ9NVI1 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
FANCIQ9NVI1 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
FANCIQ9NVI1 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
FANCIQ9NVI1 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
FANCIQ9NVI1 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
FANCIQ9NVI1 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
FANCIQ9NVI1 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
FANCIQ9NVI1 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
FANCIQ9NVI1 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC27.53■■■□□ 2
FANCIQ9NVI1 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
FANCIQ9NVI1 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
FANCIQ9NVI1 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC27.53■■■□□ 2
FANCIQ9NVI1 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
FANCIQ9NVI1 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
FANCIQ9NVI1 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
FANCIQ9NVI1 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
FANCIQ9NVI1 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
FANCIQ9NVI1 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
FANCIQ9NVI1 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
FANCIQ9NVI1 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
FANCIQ9NVI1 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
FANCIQ9NVI1 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
FANCIQ9NVI1 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
FANCIQ9NVI1 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC27.52■■■□□ 2
FANCIQ9NVI1 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
FANCIQ9NVI1 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
FANCIQ9NVI1 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
FANCIQ9NVI1 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
FANCIQ9NVI1 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
FANCIQ9NVI1 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
FANCIQ9NVI1 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
FANCIQ9NVI1 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
FANCIQ9NVI1 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
FANCIQ9NVI1 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
FANCIQ9NVI1 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC27.52■■■□□ 2
FANCIQ9NVI1 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
FANCIQ9NVI1 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
FANCIQ9NVI1 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
FANCIQ9NVI1 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
FANCIQ9NVI1 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
FANCIQ9NVI1 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 697.6 ms