Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUN5

LMBRD1, Probable lysosomal cobalamin transporter, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBRD1Q9NUN5 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LMBRD1Q9NUN5 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LMBRD1Q9NUN5 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LMBRD1Q9NUN5 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LMBRD1Q9NUN5 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LMBRD1Q9NUN5 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LMBRD1Q9NUN5 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LMBRD1Q9NUN5 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LMBRD1Q9NUN5 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LMBRD1Q9NUN5 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LMBRD1Q9NUN5 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LMBRD1Q9NUN5 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LMBRD1Q9NUN5 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LMBRD1Q9NUN5 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LMBRD1Q9NUN5 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LMBRD1Q9NUN5 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LMBRD1Q9NUN5 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LMBRD1Q9NUN5 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LMBRD1Q9NUN5 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LMBRD1Q9NUN5 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LMBRD1Q9NUN5 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LMBRD1Q9NUN5 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LMBRD1Q9NUN5 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LMBRD1Q9NUN5 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LMBRD1Q9NUN5 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LMBRD1Q9NUN5 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LMBRD1Q9NUN5 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LMBRD1Q9NUN5 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LMBRD1Q9NUN5 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LMBRD1Q9NUN5 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LMBRD1Q9NUN5 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LMBRD1Q9NUN5 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
LMBRD1Q9NUN5 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LMBRD1Q9NUN5 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LMBRD1Q9NUN5 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LMBRD1Q9NUN5 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LMBRD1Q9NUN5 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
LMBRD1Q9NUN5 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
LMBRD1Q9NUN5 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
LMBRD1Q9NUN5 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
LMBRD1Q9NUN5 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LMBRD1Q9NUN5 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LMBRD1Q9NUN5 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
LMBRD1Q9NUN5 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LMBRD1Q9NUN5 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
LMBRD1Q9NUN5 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LMBRD1Q9NUN5 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LMBRD1Q9NUN5 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LMBRD1Q9NUN5 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LMBRD1Q9NUN5 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LMBRD1Q9NUN5 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LMBRD1Q9NUN5 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LMBRD1Q9NUN5 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
LMBRD1Q9NUN5 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LMBRD1Q9NUN5 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LMBRD1Q9NUN5 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LMBRD1Q9NUN5 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LMBRD1Q9NUN5 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LMBRD1Q9NUN5 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LMBRD1Q9NUN5 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LMBRD1Q9NUN5 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LMBRD1Q9NUN5 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
LMBRD1Q9NUN5 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LMBRD1Q9NUN5 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LMBRD1Q9NUN5 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LMBRD1Q9NUN5 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LMBRD1Q9NUN5 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LMBRD1Q9NUN5 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LMBRD1Q9NUN5 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LMBRD1Q9NUN5 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LMBRD1Q9NUN5 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LMBRD1Q9NUN5 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LMBRD1Q9NUN5 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LMBRD1Q9NUN5 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LMBRD1Q9NUN5 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LMBRD1Q9NUN5 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LMBRD1Q9NUN5 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LMBRD1Q9NUN5 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LMBRD1Q9NUN5 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LMBRD1Q9NUN5 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LMBRD1Q9NUN5 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LMBRD1Q9NUN5 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LMBRD1Q9NUN5 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LMBRD1Q9NUN5 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LMBRD1Q9NUN5 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LMBRD1Q9NUN5 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LMBRD1Q9NUN5 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LMBRD1Q9NUN5 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LMBRD1Q9NUN5 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LMBRD1Q9NUN5 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
LMBRD1Q9NUN5 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LMBRD1Q9NUN5 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LMBRD1Q9NUN5 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LMBRD1Q9NUN5 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LMBRD1Q9NUN5 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LMBRD1Q9NUN5 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LMBRD1Q9NUN5 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LMBRD1Q9NUN5 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LMBRD1Q9NUN5 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LMBRD1Q9NUN5 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms