Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUE0

ZDHHC18, Palmitoyltransferase ZDHHC18, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZDHHC18Q9NUE0 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZDHHC18Q9NUE0 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZDHHC18Q9NUE0 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZDHHC18Q9NUE0 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZDHHC18Q9NUE0 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ZDHHC18Q9NUE0 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZDHHC18Q9NUE0 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ZDHHC18Q9NUE0 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZDHHC18Q9NUE0 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZDHHC18Q9NUE0 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZDHHC18Q9NUE0 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ZDHHC18Q9NUE0 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZDHHC18Q9NUE0 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZDHHC18Q9NUE0 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZDHHC18Q9NUE0 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZDHHC18Q9NUE0 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZDHHC18Q9NUE0 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZDHHC18Q9NUE0 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZDHHC18Q9NUE0 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZDHHC18Q9NUE0 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZDHHC18Q9NUE0 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZDHHC18Q9NUE0 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZDHHC18Q9NUE0 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZDHHC18Q9NUE0 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZDHHC18Q9NUE0 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZDHHC18Q9NUE0 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZDHHC18Q9NUE0 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZDHHC18Q9NUE0 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZDHHC18Q9NUE0 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZDHHC18Q9NUE0 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZDHHC18Q9NUE0 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZDHHC18Q9NUE0 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZDHHC18Q9NUE0 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZDHHC18Q9NUE0 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZDHHC18Q9NUE0 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZDHHC18Q9NUE0 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZDHHC18Q9NUE0 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZDHHC18Q9NUE0 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZDHHC18Q9NUE0 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZDHHC18Q9NUE0 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZDHHC18Q9NUE0 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZDHHC18Q9NUE0 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZDHHC18Q9NUE0 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZDHHC18Q9NUE0 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZDHHC18Q9NUE0 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZDHHC18Q9NUE0 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZDHHC18Q9NUE0 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZDHHC18Q9NUE0 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZDHHC18Q9NUE0 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZDHHC18Q9NUE0 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZDHHC18Q9NUE0 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZDHHC18Q9NUE0 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZDHHC18Q9NUE0 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZDHHC18Q9NUE0 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ZDHHC18Q9NUE0 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZDHHC18Q9NUE0 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZDHHC18Q9NUE0 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZDHHC18Q9NUE0 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZDHHC18Q9NUE0 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZDHHC18Q9NUE0 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZDHHC18Q9NUE0 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZDHHC18Q9NUE0 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZDHHC18Q9NUE0 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZDHHC18Q9NUE0 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZDHHC18Q9NUE0 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZDHHC18Q9NUE0 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZDHHC18Q9NUE0 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZDHHC18Q9NUE0 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZDHHC18Q9NUE0 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZDHHC18Q9NUE0 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZDHHC18Q9NUE0 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZDHHC18Q9NUE0 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZDHHC18Q9NUE0 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZDHHC18Q9NUE0 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZDHHC18Q9NUE0 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZDHHC18Q9NUE0 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZDHHC18Q9NUE0 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZDHHC18Q9NUE0 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZDHHC18Q9NUE0 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZDHHC18Q9NUE0 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ZDHHC18Q9NUE0 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZDHHC18Q9NUE0 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZDHHC18Q9NUE0 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ZDHHC18Q9NUE0 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZDHHC18Q9NUE0 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZDHHC18Q9NUE0 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZDHHC18Q9NUE0 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZDHHC18Q9NUE0 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZDHHC18Q9NUE0 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZDHHC18Q9NUE0 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZDHHC18Q9NUE0 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZDHHC18Q9NUE0 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZDHHC18Q9NUE0 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZDHHC18Q9NUE0 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZDHHC18Q9NUE0 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZDHHC18Q9NUE0 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
ZDHHC18Q9NUE0 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
ZDHHC18Q9NUE0 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
ZDHHC18Q9NUE0 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ZDHHC18Q9NUE0 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms