Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT62

ATG3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG3Q9NT62 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ATG3Q9NT62 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ATG3Q9NT62 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ATG3Q9NT62 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ATG3Q9NT62 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ATG3Q9NT62 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ATG3Q9NT62 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ATG3Q9NT62 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
ATG3Q9NT62 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ATG3Q9NT62 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ATG3Q9NT62 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ATG3Q9NT62 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ATG3Q9NT62 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ATG3Q9NT62 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ATG3Q9NT62 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ATG3Q9NT62 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ATG3Q9NT62 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ATG3Q9NT62 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ATG3Q9NT62 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ATG3Q9NT62 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ATG3Q9NT62 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ATG3Q9NT62 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ATG3Q9NT62 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ATG3Q9NT62 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
ATG3Q9NT62 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ATG3Q9NT62 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ATG3Q9NT62 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ATG3Q9NT62 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ATG3Q9NT62 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ATG3Q9NT62 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ATG3Q9NT62 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ATG3Q9NT62 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ATG3Q9NT62 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ATG3Q9NT62 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
ATG3Q9NT62 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ATG3Q9NT62 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ATG3Q9NT62 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ATG3Q9NT62 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ATG3Q9NT62 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
ATG3Q9NT62 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ATG3Q9NT62 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ATG3Q9NT62 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ATG3Q9NT62 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ATG3Q9NT62 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ATG3Q9NT62 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
ATG3Q9NT62 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ATG3Q9NT62 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ATG3Q9NT62 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ATG3Q9NT62 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ATG3Q9NT62 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ATG3Q9NT62 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ATG3Q9NT62 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ATG3Q9NT62 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ATG3Q9NT62 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ATG3Q9NT62 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ATG3Q9NT62 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ATG3Q9NT62 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
ATG3Q9NT62 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
ATG3Q9NT62 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
ATG3Q9NT62 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ATG3Q9NT62 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
ATG3Q9NT62 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ATG3Q9NT62 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ATG3Q9NT62 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ATG3Q9NT62 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ATG3Q9NT62 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
ATG3Q9NT62 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ATG3Q9NT62 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ATG3Q9NT62 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ATG3Q9NT62 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ATG3Q9NT62 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ATG3Q9NT62 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ATG3Q9NT62 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ATG3Q9NT62 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ATG3Q9NT62 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ATG3Q9NT62 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ATG3Q9NT62 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ATG3Q9NT62 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ATG3Q9NT62 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ATG3Q9NT62 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ATG3Q9NT62 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ATG3Q9NT62 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ATG3Q9NT62 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ATG3Q9NT62 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ATG3Q9NT62 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ATG3Q9NT62 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ATG3Q9NT62 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ATG3Q9NT62 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ATG3Q9NT62 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
ATG3Q9NT62 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ATG3Q9NT62 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ATG3Q9NT62 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ATG3Q9NT62 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ATG3Q9NT62 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ATG3Q9NT62 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ATG3Q9NT62 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ATG3Q9NT62 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
ATG3Q9NT62 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ATG3Q9NT62 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
ATG3Q9NT62 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms