Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRZ9

HELLS, Lymphoid-specific helicase, humanhuman

Predictions only

Length 838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELLSQ9NRZ9 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HELLSQ9NRZ9 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HELLSQ9NRZ9 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HELLSQ9NRZ9 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HELLSQ9NRZ9 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HELLSQ9NRZ9 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HELLSQ9NRZ9 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HELLSQ9NRZ9 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HELLSQ9NRZ9 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HELLSQ9NRZ9 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
HELLSQ9NRZ9 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HELLSQ9NRZ9 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HELLSQ9NRZ9 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HELLSQ9NRZ9 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HELLSQ9NRZ9 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HELLSQ9NRZ9 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HELLSQ9NRZ9 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HELLSQ9NRZ9 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HELLSQ9NRZ9 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
HELLSQ9NRZ9 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HELLSQ9NRZ9 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HELLSQ9NRZ9 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
HELLSQ9NRZ9 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HELLSQ9NRZ9 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HELLSQ9NRZ9 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
HELLSQ9NRZ9 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HELLSQ9NRZ9 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HELLSQ9NRZ9 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HELLSQ9NRZ9 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HELLSQ9NRZ9 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HELLSQ9NRZ9 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HELLSQ9NRZ9 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HELLSQ9NRZ9 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HELLSQ9NRZ9 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HELLSQ9NRZ9 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HELLSQ9NRZ9 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HELLSQ9NRZ9 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HELLSQ9NRZ9 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HELLSQ9NRZ9 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HELLSQ9NRZ9 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HELLSQ9NRZ9 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
HELLSQ9NRZ9 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
HELLSQ9NRZ9 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HELLSQ9NRZ9 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HELLSQ9NRZ9 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
HELLSQ9NRZ9 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HELLSQ9NRZ9 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HELLSQ9NRZ9 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HELLSQ9NRZ9 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
HELLSQ9NRZ9 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HELLSQ9NRZ9 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HELLSQ9NRZ9 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HELLSQ9NRZ9 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HELLSQ9NRZ9 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HELLSQ9NRZ9 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HELLSQ9NRZ9 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HELLSQ9NRZ9 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HELLSQ9NRZ9 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HELLSQ9NRZ9 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HELLSQ9NRZ9 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HELLSQ9NRZ9 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HELLSQ9NRZ9 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HELLSQ9NRZ9 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HELLSQ9NRZ9 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HELLSQ9NRZ9 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HELLSQ9NRZ9 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
HELLSQ9NRZ9 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HELLSQ9NRZ9 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HELLSQ9NRZ9 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HELLSQ9NRZ9 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HELLSQ9NRZ9 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HELLSQ9NRZ9 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HELLSQ9NRZ9 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
HELLSQ9NRZ9 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HELLSQ9NRZ9 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HELLSQ9NRZ9 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HELLSQ9NRZ9 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HELLSQ9NRZ9 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HELLSQ9NRZ9 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HELLSQ9NRZ9 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HELLSQ9NRZ9 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HELLSQ9NRZ9 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HELLSQ9NRZ9 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
HELLSQ9NRZ9 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HELLSQ9NRZ9 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HELLSQ9NRZ9 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HELLSQ9NRZ9 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HELLSQ9NRZ9 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HELLSQ9NRZ9 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HELLSQ9NRZ9 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HELLSQ9NRZ9 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HELLSQ9NRZ9 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HELLSQ9NRZ9 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
HELLSQ9NRZ9 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
HELLSQ9NRZ9 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HELLSQ9NRZ9 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HELLSQ9NRZ9 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HELLSQ9NRZ9 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HELLSQ9NRZ9 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HELLSQ9NRZ9 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms