Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRA0

SPHK2, Sphingosine kinase 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHK2Q9NRA0 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPHK2Q9NRA0 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPHK2Q9NRA0 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPHK2Q9NRA0 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPHK2Q9NRA0 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SPHK2Q9NRA0 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPHK2Q9NRA0 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPHK2Q9NRA0 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPHK2Q9NRA0 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPHK2Q9NRA0 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPHK2Q9NRA0 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPHK2Q9NRA0 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPHK2Q9NRA0 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPHK2Q9NRA0 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SPHK2Q9NRA0 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SPHK2Q9NRA0 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPHK2Q9NRA0 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPHK2Q9NRA0 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPHK2Q9NRA0 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPHK2Q9NRA0 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SPHK2Q9NRA0 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPHK2Q9NRA0 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPHK2Q9NRA0 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPHK2Q9NRA0 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPHK2Q9NRA0 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPHK2Q9NRA0 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPHK2Q9NRA0 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPHK2Q9NRA0 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPHK2Q9NRA0 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPHK2Q9NRA0 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SPHK2Q9NRA0 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SPHK2Q9NRA0 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPHK2Q9NRA0 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SPHK2Q9NRA0 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPHK2Q9NRA0 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPHK2Q9NRA0 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPHK2Q9NRA0 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPHK2Q9NRA0 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPHK2Q9NRA0 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPHK2Q9NRA0 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPHK2Q9NRA0 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPHK2Q9NRA0 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SPHK2Q9NRA0 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SPHK2Q9NRA0 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SPHK2Q9NRA0 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SPHK2Q9NRA0 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SPHK2Q9NRA0 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SPHK2Q9NRA0 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SPHK2Q9NRA0 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SPHK2Q9NRA0 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SPHK2Q9NRA0 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SPHK2Q9NRA0 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SPHK2Q9NRA0 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SPHK2Q9NRA0 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SPHK2Q9NRA0 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SPHK2Q9NRA0 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SPHK2Q9NRA0 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SPHK2Q9NRA0 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SPHK2Q9NRA0 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SPHK2Q9NRA0 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SPHK2Q9NRA0 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SPHK2Q9NRA0 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SPHK2Q9NRA0 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SPHK2Q9NRA0 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SPHK2Q9NRA0 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SPHK2Q9NRA0 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPHK2Q9NRA0 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPHK2Q9NRA0 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPHK2Q9NRA0 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPHK2Q9NRA0 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPHK2Q9NRA0 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPHK2Q9NRA0 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SPHK2Q9NRA0 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPHK2Q9NRA0 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPHK2Q9NRA0 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPHK2Q9NRA0 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SPHK2Q9NRA0 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPHK2Q9NRA0 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPHK2Q9NRA0 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPHK2Q9NRA0 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SPHK2Q9NRA0 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SPHK2Q9NRA0 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPHK2Q9NRA0 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPHK2Q9NRA0 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPHK2Q9NRA0 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPHK2Q9NRA0 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPHK2Q9NRA0 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPHK2Q9NRA0 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPHK2Q9NRA0 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPHK2Q9NRA0 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPHK2Q9NRA0 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPHK2Q9NRA0 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SPHK2Q9NRA0 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPHK2Q9NRA0 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPHK2Q9NRA0 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPHK2Q9NRA0 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPHK2Q9NRA0 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SPHK2Q9NRA0 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SPHK2Q9NRA0 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SPHK2Q9NRA0 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
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