Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQX3

GPHN, Gephyrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPHNQ9NQX3 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GPHNQ9NQX3 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GPHNQ9NQX3 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
GPHNQ9NQX3 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GPHNQ9NQX3 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GPHNQ9NQX3 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GPHNQ9NQX3 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GPHNQ9NQX3 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
GPHNQ9NQX3 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GPHNQ9NQX3 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GPHNQ9NQX3 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GPHNQ9NQX3 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GPHNQ9NQX3 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GPHNQ9NQX3 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GPHNQ9NQX3 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GPHNQ9NQX3 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GPHNQ9NQX3 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GPHNQ9NQX3 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GPHNQ9NQX3 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GPHNQ9NQX3 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GPHNQ9NQX3 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GPHNQ9NQX3 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GPHNQ9NQX3 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GPHNQ9NQX3 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GPHNQ9NQX3 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GPHNQ9NQX3 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GPHNQ9NQX3 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GPHNQ9NQX3 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GPHNQ9NQX3 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GPHNQ9NQX3 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
GPHNQ9NQX3 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GPHNQ9NQX3 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GPHNQ9NQX3 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
GPHNQ9NQX3 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GPHNQ9NQX3 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GPHNQ9NQX3 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GPHNQ9NQX3 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GPHNQ9NQX3 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GPHNQ9NQX3 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GPHNQ9NQX3 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GPHNQ9NQX3 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
GPHNQ9NQX3 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
GPHNQ9NQX3 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GPHNQ9NQX3 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GPHNQ9NQX3 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GPHNQ9NQX3 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GPHNQ9NQX3 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GPHNQ9NQX3 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GPHNQ9NQX3 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GPHNQ9NQX3 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GPHNQ9NQX3 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GPHNQ9NQX3 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GPHNQ9NQX3 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GPHNQ9NQX3 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GPHNQ9NQX3 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GPHNQ9NQX3 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GPHNQ9NQX3 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GPHNQ9NQX3 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GPHNQ9NQX3 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GPHNQ9NQX3 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GPHNQ9NQX3 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GPHNQ9NQX3 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GPHNQ9NQX3 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GPHNQ9NQX3 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GPHNQ9NQX3 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GPHNQ9NQX3 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GPHNQ9NQX3 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GPHNQ9NQX3 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GPHNQ9NQX3 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GPHNQ9NQX3 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GPHNQ9NQX3 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GPHNQ9NQX3 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GPHNQ9NQX3 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GPHNQ9NQX3 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GPHNQ9NQX3 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GPHNQ9NQX3 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GPHNQ9NQX3 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GPHNQ9NQX3 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GPHNQ9NQX3 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GPHNQ9NQX3 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GPHNQ9NQX3 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GPHNQ9NQX3 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GPHNQ9NQX3 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GPHNQ9NQX3 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
GPHNQ9NQX3 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
GPHNQ9NQX3 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GPHNQ9NQX3 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
GPHNQ9NQX3 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
GPHNQ9NQX3 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
GPHNQ9NQX3 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.52
GPHNQ9NQX3 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
GPHNQ9NQX3 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
GPHNQ9NQX3 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GPHNQ9NQX3 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
GPHNQ9NQX3 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GPHNQ9NQX3 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GPHNQ9NQX3 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GPHNQ9NQX3 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GPHNQ9NQX3 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GPHNQ9NQX3 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms