Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP61

ARFGAP3, ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGAP3Q9NP61 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARFGAP3Q9NP61 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARFGAP3Q9NP61 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ARFGAP3Q9NP61 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARFGAP3Q9NP61 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARFGAP3Q9NP61 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARFGAP3Q9NP61 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARFGAP3Q9NP61 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARFGAP3Q9NP61 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARFGAP3Q9NP61 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARFGAP3Q9NP61 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARFGAP3Q9NP61 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARFGAP3Q9NP61 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARFGAP3Q9NP61 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARFGAP3Q9NP61 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARFGAP3Q9NP61 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARFGAP3Q9NP61 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARFGAP3Q9NP61 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARFGAP3Q9NP61 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARFGAP3Q9NP61 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ARFGAP3Q9NP61 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARFGAP3Q9NP61 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARFGAP3Q9NP61 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARFGAP3Q9NP61 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARFGAP3Q9NP61 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARFGAP3Q9NP61 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARFGAP3Q9NP61 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARFGAP3Q9NP61 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARFGAP3Q9NP61 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARFGAP3Q9NP61 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARFGAP3Q9NP61 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARFGAP3Q9NP61 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARFGAP3Q9NP61 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARFGAP3Q9NP61 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARFGAP3Q9NP61 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARFGAP3Q9NP61 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARFGAP3Q9NP61 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARFGAP3Q9NP61 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARFGAP3Q9NP61 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARFGAP3Q9NP61 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARFGAP3Q9NP61 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARFGAP3Q9NP61 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARFGAP3Q9NP61 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARFGAP3Q9NP61 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARFGAP3Q9NP61 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARFGAP3Q9NP61 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARFGAP3Q9NP61 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARFGAP3Q9NP61 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARFGAP3Q9NP61 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARFGAP3Q9NP61 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ARFGAP3Q9NP61 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARFGAP3Q9NP61 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARFGAP3Q9NP61 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARFGAP3Q9NP61 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARFGAP3Q9NP61 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARFGAP3Q9NP61 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARFGAP3Q9NP61 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARFGAP3Q9NP61 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARFGAP3Q9NP61 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARFGAP3Q9NP61 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARFGAP3Q9NP61 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARFGAP3Q9NP61 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARFGAP3Q9NP61 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARFGAP3Q9NP61 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARFGAP3Q9NP61 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARFGAP3Q9NP61 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARFGAP3Q9NP61 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARFGAP3Q9NP61 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ARFGAP3Q9NP61 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARFGAP3Q9NP61 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARFGAP3Q9NP61 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARFGAP3Q9NP61 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARFGAP3Q9NP61 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARFGAP3Q9NP61 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARFGAP3Q9NP61 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARFGAP3Q9NP61 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ARFGAP3Q9NP61 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARFGAP3Q9NP61 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARFGAP3Q9NP61 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARFGAP3Q9NP61 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ARFGAP3Q9NP61 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARFGAP3Q9NP61 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARFGAP3Q9NP61 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARFGAP3Q9NP61 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARFGAP3Q9NP61 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARFGAP3Q9NP61 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARFGAP3Q9NP61 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARFGAP3Q9NP61 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARFGAP3Q9NP61 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARFGAP3Q9NP61 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARFGAP3Q9NP61 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ARFGAP3Q9NP61 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
ARFGAP3Q9NP61 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARFGAP3Q9NP61 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARFGAP3Q9NP61 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARFGAP3Q9NP61 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARFGAP3Q9NP61 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARFGAP3Q9NP61 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARFGAP3Q9NP61 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ARFGAP3Q9NP61 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms