Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCM2

PLXNA4, Plexin-A4, humanhuman

Predictions only

Length 1,894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNA4Q9HCM2 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PLXNA4Q9HCM2 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PLXNA4Q9HCM2 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PLXNA4Q9HCM2 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PLXNA4Q9HCM2 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PLXNA4Q9HCM2 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PLXNA4Q9HCM2 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PLXNA4Q9HCM2 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PLXNA4Q9HCM2 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PLXNA4Q9HCM2 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PLXNA4Q9HCM2 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PLXNA4Q9HCM2 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PLXNA4Q9HCM2 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PLXNA4Q9HCM2 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PLXNA4Q9HCM2 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PLXNA4Q9HCM2 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PLXNA4Q9HCM2 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PLXNA4Q9HCM2 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PLXNA4Q9HCM2 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PLXNA4Q9HCM2 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PLXNA4Q9HCM2 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PLXNA4Q9HCM2 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PLXNA4Q9HCM2 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PLXNA4Q9HCM2 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PLXNA4Q9HCM2 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PLXNA4Q9HCM2 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PLXNA4Q9HCM2 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PLXNA4Q9HCM2 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PLXNA4Q9HCM2 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PLXNA4Q9HCM2 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PLXNA4Q9HCM2 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PLXNA4Q9HCM2 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PLXNA4Q9HCM2 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PLXNA4Q9HCM2 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PLXNA4Q9HCM2 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PLXNA4Q9HCM2 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PLXNA4Q9HCM2 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PLXNA4Q9HCM2 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PLXNA4Q9HCM2 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PLXNA4Q9HCM2 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PLXNA4Q9HCM2 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PLXNA4Q9HCM2 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PLXNA4Q9HCM2 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PLXNA4Q9HCM2 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PLXNA4Q9HCM2 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PLXNA4Q9HCM2 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PLXNA4Q9HCM2 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PLXNA4Q9HCM2 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PLXNA4Q9HCM2 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PLXNA4Q9HCM2 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PLXNA4Q9HCM2 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PLXNA4Q9HCM2 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PLXNA4Q9HCM2 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PLXNA4Q9HCM2 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PLXNA4Q9HCM2 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PLXNA4Q9HCM2 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PLXNA4Q9HCM2 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PLXNA4Q9HCM2 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PLXNA4Q9HCM2 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PLXNA4Q9HCM2 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PLXNA4Q9HCM2 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PLXNA4Q9HCM2 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PLXNA4Q9HCM2 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PLXNA4Q9HCM2 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PLXNA4Q9HCM2 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PLXNA4Q9HCM2 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PLXNA4Q9HCM2 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PLXNA4Q9HCM2 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PLXNA4Q9HCM2 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PLXNA4Q9HCM2 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PLXNA4Q9HCM2 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PLXNA4Q9HCM2 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PLXNA4Q9HCM2 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PLXNA4Q9HCM2 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PLXNA4Q9HCM2 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PLXNA4Q9HCM2 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PLXNA4Q9HCM2 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PLXNA4Q9HCM2 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PLXNA4Q9HCM2 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PLXNA4Q9HCM2 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PLXNA4Q9HCM2 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PLXNA4Q9HCM2 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PLXNA4Q9HCM2 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PLXNA4Q9HCM2 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PLXNA4Q9HCM2 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PLXNA4Q9HCM2 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PLXNA4Q9HCM2 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PLXNA4Q9HCM2 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PLXNA4Q9HCM2 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PLXNA4Q9HCM2 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PLXNA4Q9HCM2 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PLXNA4Q9HCM2 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PLXNA4Q9HCM2 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PLXNA4Q9HCM2 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PLXNA4Q9HCM2 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PLXNA4Q9HCM2 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PLXNA4Q9HCM2 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PLXNA4Q9HCM2 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PLXNA4Q9HCM2 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PLXNA4Q9HCM2 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms