Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC52

CBX8, Chromobox protein homolog 8, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX8Q9HC52 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CBX8Q9HC52 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CBX8Q9HC52 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CBX8Q9HC52 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CBX8Q9HC52 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CBX8Q9HC52 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CBX8Q9HC52 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CBX8Q9HC52 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CBX8Q9HC52 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CBX8Q9HC52 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CBX8Q9HC52 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CBX8Q9HC52 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CBX8Q9HC52 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CBX8Q9HC52 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CBX8Q9HC52 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CBX8Q9HC52 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CBX8Q9HC52 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CBX8Q9HC52 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CBX8Q9HC52 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CBX8Q9HC52 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CBX8Q9HC52 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
CBX8Q9HC52 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CBX8Q9HC52 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CBX8Q9HC52 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CBX8Q9HC52 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CBX8Q9HC52 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CBX8Q9HC52 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CBX8Q9HC52 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CBX8Q9HC52 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CBX8Q9HC52 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CBX8Q9HC52 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CBX8Q9HC52 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CBX8Q9HC52 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CBX8Q9HC52 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CBX8Q9HC52 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CBX8Q9HC52 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CBX8Q9HC52 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CBX8Q9HC52 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CBX8Q9HC52 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CBX8Q9HC52 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CBX8Q9HC52 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CBX8Q9HC52 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CBX8Q9HC52 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CBX8Q9HC52 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CBX8Q9HC52 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CBX8Q9HC52 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CBX8Q9HC52 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CBX8Q9HC52 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CBX8Q9HC52 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CBX8Q9HC52 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CBX8Q9HC52 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CBX8Q9HC52 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CBX8Q9HC52 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CBX8Q9HC52 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CBX8Q9HC52 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CBX8Q9HC52 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CBX8Q9HC52 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CBX8Q9HC52 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CBX8Q9HC52 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CBX8Q9HC52 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CBX8Q9HC52 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CBX8Q9HC52 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CBX8Q9HC52 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CBX8Q9HC52 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CBX8Q9HC52 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CBX8Q9HC52 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CBX8Q9HC52 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CBX8Q9HC52 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CBX8Q9HC52 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CBX8Q9HC52 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CBX8Q9HC52 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CBX8Q9HC52 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CBX8Q9HC52 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CBX8Q9HC52 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CBX8Q9HC52 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CBX8Q9HC52 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CBX8Q9HC52 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CBX8Q9HC52 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CBX8Q9HC52 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CBX8Q9HC52 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CBX8Q9HC52 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CBX8Q9HC52 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CBX8Q9HC52 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CBX8Q9HC52 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CBX8Q9HC52 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CBX8Q9HC52 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CBX8Q9HC52 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CBX8Q9HC52 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CBX8Q9HC52 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CBX8Q9HC52 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CBX8Q9HC52 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CBX8Q9HC52 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CBX8Q9HC52 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CBX8Q9HC52 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CBX8Q9HC52 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CBX8Q9HC52 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CBX8Q9HC52 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CBX8Q9HC52 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CBX8Q9HC52 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CBX8Q9HC52 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms