Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC16

APOBEC3G, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3G, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3GQ9HC16 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
APOBEC3GQ9HC16 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
APOBEC3GQ9HC16 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
APOBEC3GQ9HC16 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
APOBEC3GQ9HC16 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
APOBEC3GQ9HC16 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
APOBEC3GQ9HC16 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
APOBEC3GQ9HC16 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
APOBEC3GQ9HC16 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
APOBEC3GQ9HC16 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
APOBEC3GQ9HC16 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
APOBEC3GQ9HC16 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
APOBEC3GQ9HC16 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
APOBEC3GQ9HC16 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
APOBEC3GQ9HC16 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
APOBEC3GQ9HC16 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
APOBEC3GQ9HC16 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
APOBEC3GQ9HC16 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
APOBEC3GQ9HC16 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
APOBEC3GQ9HC16 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
APOBEC3GQ9HC16 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
APOBEC3GQ9HC16 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
APOBEC3GQ9HC16 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
APOBEC3GQ9HC16 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
APOBEC3GQ9HC16 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
APOBEC3GQ9HC16 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
APOBEC3GQ9HC16 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
APOBEC3GQ9HC16 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
APOBEC3GQ9HC16 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
APOBEC3GQ9HC16 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
APOBEC3GQ9HC16 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
APOBEC3GQ9HC16 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
APOBEC3GQ9HC16 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
APOBEC3GQ9HC16 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
APOBEC3GQ9HC16 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
APOBEC3GQ9HC16 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
APOBEC3GQ9HC16 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
APOBEC3GQ9HC16 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
APOBEC3GQ9HC16 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
APOBEC3GQ9HC16 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
APOBEC3GQ9HC16 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
APOBEC3GQ9HC16 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
APOBEC3GQ9HC16 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
APOBEC3GQ9HC16 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
APOBEC3GQ9HC16 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
APOBEC3GQ9HC16 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
APOBEC3GQ9HC16 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
APOBEC3GQ9HC16 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
APOBEC3GQ9HC16 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
APOBEC3GQ9HC16 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
APOBEC3GQ9HC16 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
APOBEC3GQ9HC16 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
APOBEC3GQ9HC16 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
APOBEC3GQ9HC16 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
APOBEC3GQ9HC16 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
APOBEC3GQ9HC16 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
APOBEC3GQ9HC16 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
APOBEC3GQ9HC16 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
APOBEC3GQ9HC16 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
APOBEC3GQ9HC16 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
APOBEC3GQ9HC16 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
APOBEC3GQ9HC16 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
APOBEC3GQ9HC16 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
APOBEC3GQ9HC16 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
APOBEC3GQ9HC16 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
APOBEC3GQ9HC16 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
APOBEC3GQ9HC16 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
APOBEC3GQ9HC16 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
APOBEC3GQ9HC16 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
APOBEC3GQ9HC16 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
APOBEC3GQ9HC16 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
APOBEC3GQ9HC16 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
APOBEC3GQ9HC16 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
APOBEC3GQ9HC16 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
APOBEC3GQ9HC16 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
APOBEC3GQ9HC16 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
APOBEC3GQ9HC16 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
APOBEC3GQ9HC16 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
APOBEC3GQ9HC16 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
APOBEC3GQ9HC16 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
APOBEC3GQ9HC16 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
APOBEC3GQ9HC16 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
APOBEC3GQ9HC16 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
APOBEC3GQ9HC16 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
APOBEC3GQ9HC16 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
APOBEC3GQ9HC16 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
APOBEC3GQ9HC16 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
APOBEC3GQ9HC16 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
APOBEC3GQ9HC16 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
APOBEC3GQ9HC16 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
APOBEC3GQ9HC16 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
APOBEC3GQ9HC16 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
APOBEC3GQ9HC16 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
APOBEC3GQ9HC16 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
APOBEC3GQ9HC16 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
APOBEC3GQ9HC16 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
APOBEC3GQ9HC16 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
APOBEC3GQ9HC16 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
APOBEC3GQ9HC16 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
APOBEC3GQ9HC16 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms