Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB65

ELL3, RNA polymerase II elongation factor ELL3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELL3Q9HB65 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ELL3Q9HB65 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ELL3Q9HB65 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ELL3Q9HB65 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ELL3Q9HB65 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ELL3Q9HB65 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ELL3Q9HB65 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ELL3Q9HB65 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ELL3Q9HB65 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ELL3Q9HB65 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ELL3Q9HB65 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ELL3Q9HB65 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ELL3Q9HB65 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ELL3Q9HB65 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ELL3Q9HB65 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ELL3Q9HB65 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ELL3Q9HB65 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ELL3Q9HB65 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ELL3Q9HB65 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ELL3Q9HB65 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ELL3Q9HB65 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ELL3Q9HB65 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ELL3Q9HB65 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ELL3Q9HB65 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ELL3Q9HB65 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ELL3Q9HB65 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ELL3Q9HB65 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ELL3Q9HB65 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ELL3Q9HB65 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ELL3Q9HB65 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
ELL3Q9HB65 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ELL3Q9HB65 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ELL3Q9HB65 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ELL3Q9HB65 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ELL3Q9HB65 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ELL3Q9HB65 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ELL3Q9HB65 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ELL3Q9HB65 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ELL3Q9HB65 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ELL3Q9HB65 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ELL3Q9HB65 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ELL3Q9HB65 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ELL3Q9HB65 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ELL3Q9HB65 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ELL3Q9HB65 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ELL3Q9HB65 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ELL3Q9HB65 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ELL3Q9HB65 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ELL3Q9HB65 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ELL3Q9HB65 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ELL3Q9HB65 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ELL3Q9HB65 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ELL3Q9HB65 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ELL3Q9HB65 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ELL3Q9HB65 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ELL3Q9HB65 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ELL3Q9HB65 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ELL3Q9HB65 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ELL3Q9HB65 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
ELL3Q9HB65 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ELL3Q9HB65 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ELL3Q9HB65 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ELL3Q9HB65 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ELL3Q9HB65 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ELL3Q9HB65 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ELL3Q9HB65 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ELL3Q9HB65 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ELL3Q9HB65 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ELL3Q9HB65 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ELL3Q9HB65 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ELL3Q9HB65 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ELL3Q9HB65 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ELL3Q9HB65 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ELL3Q9HB65 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ELL3Q9HB65 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ELL3Q9HB65 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ELL3Q9HB65 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ELL3Q9HB65 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ELL3Q9HB65 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ELL3Q9HB65 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ELL3Q9HB65 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ELL3Q9HB65 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ELL3Q9HB65 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ELL3Q9HB65 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ELL3Q9HB65 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
ELL3Q9HB65 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ELL3Q9HB65 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ELL3Q9HB65 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ELL3Q9HB65 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ELL3Q9HB65 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ELL3Q9HB65 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ELL3Q9HB65 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
ELL3Q9HB65 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
ELL3Q9HB65 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
ELL3Q9HB65 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ELL3Q9HB65 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ELL3Q9HB65 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ELL3Q9HB65 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ELL3Q9HB65 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
ELL3Q9HB65 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms