Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7C4

SYNC, Syncoilin, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNCQ9H7C4 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYNCQ9H7C4 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYNCQ9H7C4 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYNCQ9H7C4 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYNCQ9H7C4 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYNCQ9H7C4 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYNCQ9H7C4 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYNCQ9H7C4 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SYNCQ9H7C4 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYNCQ9H7C4 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYNCQ9H7C4 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYNCQ9H7C4 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYNCQ9H7C4 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYNCQ9H7C4 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYNCQ9H7C4 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYNCQ9H7C4 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SYNCQ9H7C4 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYNCQ9H7C4 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYNCQ9H7C4 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYNCQ9H7C4 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYNCQ9H7C4 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYNCQ9H7C4 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SYNCQ9H7C4 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
SYNCQ9H7C4 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYNCQ9H7C4 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYNCQ9H7C4 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYNCQ9H7C4 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYNCQ9H7C4 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SYNCQ9H7C4 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYNCQ9H7C4 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYNCQ9H7C4 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYNCQ9H7C4 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYNCQ9H7C4 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYNCQ9H7C4 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYNCQ9H7C4 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYNCQ9H7C4 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYNCQ9H7C4 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYNCQ9H7C4 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYNCQ9H7C4 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYNCQ9H7C4 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SYNCQ9H7C4 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYNCQ9H7C4 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYNCQ9H7C4 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYNCQ9H7C4 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYNCQ9H7C4 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYNCQ9H7C4 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYNCQ9H7C4 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYNCQ9H7C4 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYNCQ9H7C4 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYNCQ9H7C4 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYNCQ9H7C4 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYNCQ9H7C4 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SYNCQ9H7C4 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SYNCQ9H7C4 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SYNCQ9H7C4 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYNCQ9H7C4 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYNCQ9H7C4 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYNCQ9H7C4 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYNCQ9H7C4 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYNCQ9H7C4 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SYNCQ9H7C4 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SYNCQ9H7C4 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYNCQ9H7C4 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYNCQ9H7C4 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYNCQ9H7C4 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYNCQ9H7C4 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYNCQ9H7C4 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYNCQ9H7C4 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYNCQ9H7C4 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYNCQ9H7C4 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYNCQ9H7C4 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYNCQ9H7C4 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SYNCQ9H7C4 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYNCQ9H7C4 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYNCQ9H7C4 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYNCQ9H7C4 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYNCQ9H7C4 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYNCQ9H7C4 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYNCQ9H7C4 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SYNCQ9H7C4 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYNCQ9H7C4 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYNCQ9H7C4 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SYNCQ9H7C4 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYNCQ9H7C4 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYNCQ9H7C4 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYNCQ9H7C4 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYNCQ9H7C4 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SYNCQ9H7C4 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYNCQ9H7C4 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SYNCQ9H7C4 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYNCQ9H7C4 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SYNCQ9H7C4 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SYNCQ9H7C4 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SYNCQ9H7C4 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SYNCQ9H7C4 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SYNCQ9H7C4 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
SYNCQ9H7C4 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SYNCQ9H7C4 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SYNCQ9H7C4 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SYNCQ9H7C4 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms