Protein–RNA interactions for Protein: Q9H788

SH2D4A, SH2 domain-containing protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH2D4AQ9H788 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SH2D4AQ9H788 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SH2D4AQ9H788 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SH2D4AQ9H788 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SH2D4AQ9H788 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SH2D4AQ9H788 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SH2D4AQ9H788 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SH2D4AQ9H788 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SH2D4AQ9H788 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SH2D4AQ9H788 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SH2D4AQ9H788 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SH2D4AQ9H788 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SH2D4AQ9H788 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SH2D4AQ9H788 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SH2D4AQ9H788 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SH2D4AQ9H788 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SH2D4AQ9H788 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SH2D4AQ9H788 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SH2D4AQ9H788 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SH2D4AQ9H788 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SH2D4AQ9H788 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SH2D4AQ9H788 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
SH2D4AQ9H788 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SH2D4AQ9H788 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SH2D4AQ9H788 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SH2D4AQ9H788 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SH2D4AQ9H788 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SH2D4AQ9H788 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SH2D4AQ9H788 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SH2D4AQ9H788 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SH2D4AQ9H788 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SH2D4AQ9H788 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SH2D4AQ9H788 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SH2D4AQ9H788 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SH2D4AQ9H788 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SH2D4AQ9H788 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SH2D4AQ9H788 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SH2D4AQ9H788 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SH2D4AQ9H788 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SH2D4AQ9H788 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SH2D4AQ9H788 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SH2D4AQ9H788 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SH2D4AQ9H788 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SH2D4AQ9H788 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SH2D4AQ9H788 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SH2D4AQ9H788 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SH2D4AQ9H788 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
SH2D4AQ9H788 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
SH2D4AQ9H788 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SH2D4AQ9H788 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SH2D4AQ9H788 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SH2D4AQ9H788 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SH2D4AQ9H788 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SH2D4AQ9H788 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SH2D4AQ9H788 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SH2D4AQ9H788 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SH2D4AQ9H788 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SH2D4AQ9H788 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SH2D4AQ9H788 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SH2D4AQ9H788 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SH2D4AQ9H788 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SH2D4AQ9H788 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SH2D4AQ9H788 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SH2D4AQ9H788 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SH2D4AQ9H788 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SH2D4AQ9H788 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SH2D4AQ9H788 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SH2D4AQ9H788 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SH2D4AQ9H788 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SH2D4AQ9H788 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SH2D4AQ9H788 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SH2D4AQ9H788 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SH2D4AQ9H788 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SH2D4AQ9H788 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SH2D4AQ9H788 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SH2D4AQ9H788 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SH2D4AQ9H788 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SH2D4AQ9H788 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SH2D4AQ9H788 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SH2D4AQ9H788 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SH2D4AQ9H788 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SH2D4AQ9H788 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SH2D4AQ9H788 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SH2D4AQ9H788 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SH2D4AQ9H788 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SH2D4AQ9H788 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SH2D4AQ9H788 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SH2D4AQ9H788 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SH2D4AQ9H788 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SH2D4AQ9H788 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SH2D4AQ9H788 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SH2D4AQ9H788 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SH2D4AQ9H788 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SH2D4AQ9H788 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SH2D4AQ9H788 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SH2D4AQ9H788 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SH2D4AQ9H788 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SH2D4AQ9H788 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SH2D4AQ9H788 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SH2D4AQ9H788 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms