Protein–RNA interactions for Protein: Q9H422

HIPK3, Homeodomain-interacting protein kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIPK3Q9H422 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HIPK3Q9H422 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HIPK3Q9H422 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HIPK3Q9H422 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HIPK3Q9H422 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HIPK3Q9H422 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HIPK3Q9H422 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HIPK3Q9H422 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HIPK3Q9H422 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
HIPK3Q9H422 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
HIPK3Q9H422 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HIPK3Q9H422 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
HIPK3Q9H422 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HIPK3Q9H422 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HIPK3Q9H422 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HIPK3Q9H422 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HIPK3Q9H422 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HIPK3Q9H422 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HIPK3Q9H422 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HIPK3Q9H422 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HIPK3Q9H422 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HIPK3Q9H422 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HIPK3Q9H422 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HIPK3Q9H422 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HIPK3Q9H422 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HIPK3Q9H422 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HIPK3Q9H422 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HIPK3Q9H422 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HIPK3Q9H422 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HIPK3Q9H422 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HIPK3Q9H422 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HIPK3Q9H422 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HIPK3Q9H422 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HIPK3Q9H422 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HIPK3Q9H422 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HIPK3Q9H422 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HIPK3Q9H422 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HIPK3Q9H422 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HIPK3Q9H422 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HIPK3Q9H422 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HIPK3Q9H422 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HIPK3Q9H422 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HIPK3Q9H422 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HIPK3Q9H422 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HIPK3Q9H422 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HIPK3Q9H422 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HIPK3Q9H422 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HIPK3Q9H422 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HIPK3Q9H422 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HIPK3Q9H422 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HIPK3Q9H422 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
HIPK3Q9H422 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HIPK3Q9H422 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HIPK3Q9H422 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HIPK3Q9H422 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
HIPK3Q9H422 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HIPK3Q9H422 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HIPK3Q9H422 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HIPK3Q9H422 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HIPK3Q9H422 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HIPK3Q9H422 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HIPK3Q9H422 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HIPK3Q9H422 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HIPK3Q9H422 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HIPK3Q9H422 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HIPK3Q9H422 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HIPK3Q9H422 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HIPK3Q9H422 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HIPK3Q9H422 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HIPK3Q9H422 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
HIPK3Q9H422 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HIPK3Q9H422 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
HIPK3Q9H422 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HIPK3Q9H422 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HIPK3Q9H422 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HIPK3Q9H422 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
HIPK3Q9H422 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HIPK3Q9H422 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HIPK3Q9H422 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HIPK3Q9H422 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HIPK3Q9H422 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HIPK3Q9H422 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HIPK3Q9H422 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HIPK3Q9H422 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HIPK3Q9H422 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HIPK3Q9H422 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HIPK3Q9H422 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HIPK3Q9H422 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HIPK3Q9H422 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HIPK3Q9H422 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HIPK3Q9H422 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HIPK3Q9H422 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HIPK3Q9H422 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HIPK3Q9H422 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HIPK3Q9H422 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HIPK3Q9H422 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HIPK3Q9H422 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
HIPK3Q9H422 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HIPK3Q9H422 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HIPK3Q9H422 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms