Protein–RNA interactions for Protein: Q9H190

SDCBP2, Syntenin-2, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDCBP2Q9H190 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SDCBP2Q9H190 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SDCBP2Q9H190 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SDCBP2Q9H190 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SDCBP2Q9H190 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SDCBP2Q9H190 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SDCBP2Q9H190 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SDCBP2Q9H190 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SDCBP2Q9H190 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SDCBP2Q9H190 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SDCBP2Q9H190 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SDCBP2Q9H190 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SDCBP2Q9H190 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SDCBP2Q9H190 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SDCBP2Q9H190 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SDCBP2Q9H190 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SDCBP2Q9H190 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SDCBP2Q9H190 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SDCBP2Q9H190 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SDCBP2Q9H190 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SDCBP2Q9H190 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SDCBP2Q9H190 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SDCBP2Q9H190 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SDCBP2Q9H190 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SDCBP2Q9H190 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SDCBP2Q9H190 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SDCBP2Q9H190 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SDCBP2Q9H190 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SDCBP2Q9H190 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SDCBP2Q9H190 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SDCBP2Q9H190 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SDCBP2Q9H190 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SDCBP2Q9H190 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SDCBP2Q9H190 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SDCBP2Q9H190 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SDCBP2Q9H190 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SDCBP2Q9H190 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SDCBP2Q9H190 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SDCBP2Q9H190 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SDCBP2Q9H190 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SDCBP2Q9H190 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SDCBP2Q9H190 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SDCBP2Q9H190 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SDCBP2Q9H190 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SDCBP2Q9H190 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SDCBP2Q9H190 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SDCBP2Q9H190 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SDCBP2Q9H190 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SDCBP2Q9H190 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SDCBP2Q9H190 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SDCBP2Q9H190 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SDCBP2Q9H190 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SDCBP2Q9H190 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SDCBP2Q9H190 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SDCBP2Q9H190 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SDCBP2Q9H190 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SDCBP2Q9H190 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SDCBP2Q9H190 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SDCBP2Q9H190 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SDCBP2Q9H190 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SDCBP2Q9H190 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SDCBP2Q9H190 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SDCBP2Q9H190 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SDCBP2Q9H190 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SDCBP2Q9H190 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SDCBP2Q9H190 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SDCBP2Q9H190 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SDCBP2Q9H190 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SDCBP2Q9H190 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SDCBP2Q9H190 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SDCBP2Q9H190 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SDCBP2Q9H190 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SDCBP2Q9H190 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SDCBP2Q9H190 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SDCBP2Q9H190 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SDCBP2Q9H190 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SDCBP2Q9H190 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SDCBP2Q9H190 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SDCBP2Q9H190 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SDCBP2Q9H190 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SDCBP2Q9H190 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SDCBP2Q9H190 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SDCBP2Q9H190 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SDCBP2Q9H190 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SDCBP2Q9H190 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SDCBP2Q9H190 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SDCBP2Q9H190 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SDCBP2Q9H190 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SDCBP2Q9H190 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SDCBP2Q9H190 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SDCBP2Q9H190 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SDCBP2Q9H190 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SDCBP2Q9H190 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SDCBP2Q9H190 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SDCBP2Q9H190 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SDCBP2Q9H190 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SDCBP2Q9H190 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SDCBP2Q9H190 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SDCBP2Q9H190 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SDCBP2Q9H190 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms