Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0I3

CCDC113, Coiled-coil domain-containing protein 113, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC113Q9H0I3 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC113Q9H0I3 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC113Q9H0I3 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC113Q9H0I3 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC113Q9H0I3 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC113Q9H0I3 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC113Q9H0I3 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC113Q9H0I3 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC113Q9H0I3 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC113Q9H0I3 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC113Q9H0I3 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC113Q9H0I3 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC113Q9H0I3 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC113Q9H0I3 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC113Q9H0I3 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC113Q9H0I3 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC113Q9H0I3 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC113Q9H0I3 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC113Q9H0I3 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC113Q9H0I3 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC113Q9H0I3 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC113Q9H0I3 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC113Q9H0I3 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC113Q9H0I3 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC113Q9H0I3 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC113Q9H0I3 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC113Q9H0I3 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC113Q9H0I3 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC113Q9H0I3 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC113Q9H0I3 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC113Q9H0I3 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC113Q9H0I3 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC113Q9H0I3 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC113Q9H0I3 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC113Q9H0I3 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC113Q9H0I3 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC113Q9H0I3 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC113Q9H0I3 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC113Q9H0I3 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC113Q9H0I3 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC113Q9H0I3 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC113Q9H0I3 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC113Q9H0I3 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC113Q9H0I3 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC113Q9H0I3 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC113Q9H0I3 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC113Q9H0I3 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC113Q9H0I3 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC113Q9H0I3 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC113Q9H0I3 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC113Q9H0I3 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC113Q9H0I3 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC113Q9H0I3 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC113Q9H0I3 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC113Q9H0I3 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC113Q9H0I3 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC113Q9H0I3 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC113Q9H0I3 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC113Q9H0I3 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC113Q9H0I3 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC113Q9H0I3 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC113Q9H0I3 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC113Q9H0I3 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC113Q9H0I3 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC113Q9H0I3 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC113Q9H0I3 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC113Q9H0I3 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC113Q9H0I3 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC113Q9H0I3 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC113Q9H0I3 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC113Q9H0I3 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC113Q9H0I3 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC113Q9H0I3 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC113Q9H0I3 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC113Q9H0I3 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC113Q9H0I3 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC113Q9H0I3 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC113Q9H0I3 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC113Q9H0I3 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC113Q9H0I3 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC113Q9H0I3 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC113Q9H0I3 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC113Q9H0I3 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC113Q9H0I3 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC113Q9H0I3 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC113Q9H0I3 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC113Q9H0I3 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC113Q9H0I3 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC113Q9H0I3 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC113Q9H0I3 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC113Q9H0I3 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC113Q9H0I3 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC113Q9H0I3 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC113Q9H0I3 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC113Q9H0I3 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC113Q9H0I3 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC113Q9H0I3 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC113Q9H0I3 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC113Q9H0I3 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCDC113Q9H0I3 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms