Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU7

CTDSP1, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 1, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP1Q9GZU7 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTDSP1Q9GZU7 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTDSP1Q9GZU7 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTDSP1Q9GZU7 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTDSP1Q9GZU7 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTDSP1Q9GZU7 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTDSP1Q9GZU7 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTDSP1Q9GZU7 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CTDSP1Q9GZU7 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.18
CTDSP1Q9GZU7 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
CTDSP1Q9GZU7 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
CTDSP1Q9GZU7 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTDSP1Q9GZU7 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTDSP1Q9GZU7 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTDSP1Q9GZU7 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTDSP1Q9GZU7 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTDSP1Q9GZU7 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTDSP1Q9GZU7 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTDSP1Q9GZU7 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CTDSP1Q9GZU7 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTDSP1Q9GZU7 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTDSP1Q9GZU7 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTDSP1Q9GZU7 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTDSP1Q9GZU7 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTDSP1Q9GZU7 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTDSP1Q9GZU7 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTDSP1Q9GZU7 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTDSP1Q9GZU7 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CTDSP1Q9GZU7 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTDSP1Q9GZU7 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTDSP1Q9GZU7 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTDSP1Q9GZU7 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTDSP1Q9GZU7 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTDSP1Q9GZU7 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTDSP1Q9GZU7 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTDSP1Q9GZU7 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTDSP1Q9GZU7 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTDSP1Q9GZU7 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTDSP1Q9GZU7 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CTDSP1Q9GZU7 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTDSP1Q9GZU7 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTDSP1Q9GZU7 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTDSP1Q9GZU7 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTDSP1Q9GZU7 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTDSP1Q9GZU7 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTDSP1Q9GZU7 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTDSP1Q9GZU7 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTDSP1Q9GZU7 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTDSP1Q9GZU7 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CTDSP1Q9GZU7 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CTDSP1Q9GZU7 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTDSP1Q9GZU7 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTDSP1Q9GZU7 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CTDSP1Q9GZU7 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTDSP1Q9GZU7 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTDSP1Q9GZU7 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTDSP1Q9GZU7 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTDSP1Q9GZU7 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CTDSP1Q9GZU7 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTDSP1Q9GZU7 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CTDSP1Q9GZU7 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTDSP1Q9GZU7 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CTDSP1Q9GZU7 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTDSP1Q9GZU7 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTDSP1Q9GZU7 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTDSP1Q9GZU7 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CTDSP1Q9GZU7 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTDSP1Q9GZU7 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTDSP1Q9GZU7 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTDSP1Q9GZU7 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTDSP1Q9GZU7 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTDSP1Q9GZU7 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTDSP1Q9GZU7 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTDSP1Q9GZU7 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTDSP1Q9GZU7 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTDSP1Q9GZU7 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTDSP1Q9GZU7 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTDSP1Q9GZU7 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTDSP1Q9GZU7 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTDSP1Q9GZU7 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTDSP1Q9GZU7 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTDSP1Q9GZU7 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CTDSP1Q9GZU7 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTDSP1Q9GZU7 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTDSP1Q9GZU7 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTDSP1Q9GZU7 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTDSP1Q9GZU7 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTDSP1Q9GZU7 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTDSP1Q9GZU7 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTDSP1Q9GZU7 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTDSP1Q9GZU7 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTDSP1Q9GZU7 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTDSP1Q9GZU7 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CTDSP1Q9GZU7 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTDSP1Q9GZU7 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CTDSP1Q9GZU7 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTDSP1Q9GZU7 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTDSP1Q9GZU7 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTDSP1Q9GZU7 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CTDSP1Q9GZU7 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms