Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0H6

KLHL4, Kelch-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL4Q9C0H6 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KLHL4Q9C0H6 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KLHL4Q9C0H6 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
KLHL4Q9C0H6 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KLHL4Q9C0H6 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KLHL4Q9C0H6 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KLHL4Q9C0H6 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KLHL4Q9C0H6 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
KLHL4Q9C0H6 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KLHL4Q9C0H6 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
KLHL4Q9C0H6 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
KLHL4Q9C0H6 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KLHL4Q9C0H6 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
KLHL4Q9C0H6 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
KLHL4Q9C0H6 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KLHL4Q9C0H6 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KLHL4Q9C0H6 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KLHL4Q9C0H6 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
KLHL4Q9C0H6 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KLHL4Q9C0H6 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KLHL4Q9C0H6 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
KLHL4Q9C0H6 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KLHL4Q9C0H6 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KLHL4Q9C0H6 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KLHL4Q9C0H6 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
KLHL4Q9C0H6 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KLHL4Q9C0H6 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KLHL4Q9C0H6 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KLHL4Q9C0H6 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KLHL4Q9C0H6 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KLHL4Q9C0H6 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
KLHL4Q9C0H6 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
KLHL4Q9C0H6 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KLHL4Q9C0H6 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
KLHL4Q9C0H6 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KLHL4Q9C0H6 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
KLHL4Q9C0H6 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
KLHL4Q9C0H6 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
KLHL4Q9C0H6 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
KLHL4Q9C0H6 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
KLHL4Q9C0H6 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
KLHL4Q9C0H6 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KLHL4Q9C0H6 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KLHL4Q9C0H6 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KLHL4Q9C0H6 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
KLHL4Q9C0H6 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
KLHL4Q9C0H6 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
KLHL4Q9C0H6 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KLHL4Q9C0H6 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
KLHL4Q9C0H6 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KLHL4Q9C0H6 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KLHL4Q9C0H6 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KLHL4Q9C0H6 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KLHL4Q9C0H6 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KLHL4Q9C0H6 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
KLHL4Q9C0H6 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
KLHL4Q9C0H6 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
KLHL4Q9C0H6 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
KLHL4Q9C0H6 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
KLHL4Q9C0H6 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
KLHL4Q9C0H6 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
KLHL4Q9C0H6 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
KLHL4Q9C0H6 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
KLHL4Q9C0H6 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
KLHL4Q9C0H6 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
KLHL4Q9C0H6 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
KLHL4Q9C0H6 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
KLHL4Q9C0H6 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
KLHL4Q9C0H6 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
KLHL4Q9C0H6 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
KLHL4Q9C0H6 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
KLHL4Q9C0H6 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
KLHL4Q9C0H6 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
KLHL4Q9C0H6 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
KLHL4Q9C0H6 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
KLHL4Q9C0H6 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
KLHL4Q9C0H6 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
KLHL4Q9C0H6 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
KLHL4Q9C0H6 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
KLHL4Q9C0H6 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
KLHL4Q9C0H6 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
KLHL4Q9C0H6 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
KLHL4Q9C0H6 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
KLHL4Q9C0H6 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
KLHL4Q9C0H6 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
KLHL4Q9C0H6 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
KLHL4Q9C0H6 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
KLHL4Q9C0H6 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
KLHL4Q9C0H6 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
KLHL4Q9C0H6 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
KLHL4Q9C0H6 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
KLHL4Q9C0H6 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
KLHL4Q9C0H6 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
KLHL4Q9C0H6 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
KLHL4Q9C0H6 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
KLHL4Q9C0H6 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
KLHL4Q9C0H6 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
KLHL4Q9C0H6 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
KLHL4Q9C0H6 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
KLHL4Q9C0H6 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms