Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D7

ZC3H12C, Probable ribonuclease ZC3H12C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 883 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZC3H12CQ9C0D7 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZC3H12CQ9C0D7 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZC3H12CQ9C0D7 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZC3H12CQ9C0D7 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZC3H12CQ9C0D7 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZC3H12CQ9C0D7 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZC3H12CQ9C0D7 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZC3H12CQ9C0D7 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZC3H12CQ9C0D7 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZC3H12CQ9C0D7 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZC3H12CQ9C0D7 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZC3H12CQ9C0D7 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZC3H12CQ9C0D7 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZC3H12CQ9C0D7 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZC3H12CQ9C0D7 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
ZC3H12CQ9C0D7 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZC3H12CQ9C0D7 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZC3H12CQ9C0D7 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZC3H12CQ9C0D7 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
ZC3H12CQ9C0D7 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZC3H12CQ9C0D7 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZC3H12CQ9C0D7 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZC3H12CQ9C0D7 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZC3H12CQ9C0D7 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZC3H12CQ9C0D7 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZC3H12CQ9C0D7 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZC3H12CQ9C0D7 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZC3H12CQ9C0D7 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZC3H12CQ9C0D7 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZC3H12CQ9C0D7 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZC3H12CQ9C0D7 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZC3H12CQ9C0D7 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
ZC3H12CQ9C0D7 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
ZC3H12CQ9C0D7 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZC3H12CQ9C0D7 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZC3H12CQ9C0D7 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZC3H12CQ9C0D7 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
ZC3H12CQ9C0D7 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZC3H12CQ9C0D7 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZC3H12CQ9C0D7 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZC3H12CQ9C0D7 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZC3H12CQ9C0D7 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZC3H12CQ9C0D7 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZC3H12CQ9C0D7 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZC3H12CQ9C0D7 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZC3H12CQ9C0D7 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZC3H12CQ9C0D7 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZC3H12CQ9C0D7 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZC3H12CQ9C0D7 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZC3H12CQ9C0D7 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZC3H12CQ9C0D7 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZC3H12CQ9C0D7 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZC3H12CQ9C0D7 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZC3H12CQ9C0D7 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZC3H12CQ9C0D7 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZC3H12CQ9C0D7 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
ZC3H12CQ9C0D7 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZC3H12CQ9C0D7 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZC3H12CQ9C0D7 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZC3H12CQ9C0D7 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZC3H12CQ9C0D7 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
ZC3H12CQ9C0D7 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZC3H12CQ9C0D7 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZC3H12CQ9C0D7 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZC3H12CQ9C0D7 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZC3H12CQ9C0D7 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZC3H12CQ9C0D7 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZC3H12CQ9C0D7 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZC3H12CQ9C0D7 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZC3H12CQ9C0D7 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZC3H12CQ9C0D7 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
ZC3H12CQ9C0D7 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZC3H12CQ9C0D7 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZC3H12CQ9C0D7 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZC3H12CQ9C0D7 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZC3H12CQ9C0D7 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZC3H12CQ9C0D7 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZC3H12CQ9C0D7 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZC3H12CQ9C0D7 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZC3H12CQ9C0D7 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZC3H12CQ9C0D7 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
ZC3H12CQ9C0D7 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZC3H12CQ9C0D7 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZC3H12CQ9C0D7 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZC3H12CQ9C0D7 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
ZC3H12CQ9C0D7 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZC3H12CQ9C0D7 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZC3H12CQ9C0D7 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZC3H12CQ9C0D7 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZC3H12CQ9C0D7 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZC3H12CQ9C0D7 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZC3H12CQ9C0D7 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZC3H12CQ9C0D7 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZC3H12CQ9C0D7 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZC3H12CQ9C0D7 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZC3H12CQ9C0D7 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZC3H12CQ9C0D7 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZC3H12CQ9C0D7 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZC3H12CQ9C0D7 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZC3H12CQ9C0D7 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms