Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C7

AMBRA1, Activating molecule in BECN1-regulated autophagy protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMBRA1Q9C0C7 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
AMBRA1Q9C0C7 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
AMBRA1Q9C0C7 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
AMBRA1Q9C0C7 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
AMBRA1Q9C0C7 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
AMBRA1Q9C0C7 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
AMBRA1Q9C0C7 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
AMBRA1Q9C0C7 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
AMBRA1Q9C0C7 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
AMBRA1Q9C0C7 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
AMBRA1Q9C0C7 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
AMBRA1Q9C0C7 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
AMBRA1Q9C0C7 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
AMBRA1Q9C0C7 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
AMBRA1Q9C0C7 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
AMBRA1Q9C0C7 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
AMBRA1Q9C0C7 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
AMBRA1Q9C0C7 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
AMBRA1Q9C0C7 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
AMBRA1Q9C0C7 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
AMBRA1Q9C0C7 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
AMBRA1Q9C0C7 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
AMBRA1Q9C0C7 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
AMBRA1Q9C0C7 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
AMBRA1Q9C0C7 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
AMBRA1Q9C0C7 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
AMBRA1Q9C0C7 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
AMBRA1Q9C0C7 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
AMBRA1Q9C0C7 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
AMBRA1Q9C0C7 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
AMBRA1Q9C0C7 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
AMBRA1Q9C0C7 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
AMBRA1Q9C0C7 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
AMBRA1Q9C0C7 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
AMBRA1Q9C0C7 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
AMBRA1Q9C0C7 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
AMBRA1Q9C0C7 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
AMBRA1Q9C0C7 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
AMBRA1Q9C0C7 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
AMBRA1Q9C0C7 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
AMBRA1Q9C0C7 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
AMBRA1Q9C0C7 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
AMBRA1Q9C0C7 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
AMBRA1Q9C0C7 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
AMBRA1Q9C0C7 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
AMBRA1Q9C0C7 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
AMBRA1Q9C0C7 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
AMBRA1Q9C0C7 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
AMBRA1Q9C0C7 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
AMBRA1Q9C0C7 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
AMBRA1Q9C0C7 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
AMBRA1Q9C0C7 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
AMBRA1Q9C0C7 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
AMBRA1Q9C0C7 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
AMBRA1Q9C0C7 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
AMBRA1Q9C0C7 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
AMBRA1Q9C0C7 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
AMBRA1Q9C0C7 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
AMBRA1Q9C0C7 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
AMBRA1Q9C0C7 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
AMBRA1Q9C0C7 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
AMBRA1Q9C0C7 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
AMBRA1Q9C0C7 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
AMBRA1Q9C0C7 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
AMBRA1Q9C0C7 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
AMBRA1Q9C0C7 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
AMBRA1Q9C0C7 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
AMBRA1Q9C0C7 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
AMBRA1Q9C0C7 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
AMBRA1Q9C0C7 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
AMBRA1Q9C0C7 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
AMBRA1Q9C0C7 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
AMBRA1Q9C0C7 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
AMBRA1Q9C0C7 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
AMBRA1Q9C0C7 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
AMBRA1Q9C0C7 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
AMBRA1Q9C0C7 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
AMBRA1Q9C0C7 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
AMBRA1Q9C0C7 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
AMBRA1Q9C0C7 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
AMBRA1Q9C0C7 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
AMBRA1Q9C0C7 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
AMBRA1Q9C0C7 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
AMBRA1Q9C0C7 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
AMBRA1Q9C0C7 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
AMBRA1Q9C0C7 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
AMBRA1Q9C0C7 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
AMBRA1Q9C0C7 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
AMBRA1Q9C0C7 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
AMBRA1Q9C0C7 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
AMBRA1Q9C0C7 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
AMBRA1Q9C0C7 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
AMBRA1Q9C0C7 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
AMBRA1Q9C0C7 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
AMBRA1Q9C0C7 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
AMBRA1Q9C0C7 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
AMBRA1Q9C0C7 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
AMBRA1Q9C0C7 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
AMBRA1Q9C0C7 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
AMBRA1Q9C0C7 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms