Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FOXQ1Q9C009 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FOXQ1Q9C009 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FOXQ1Q9C009 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FOXQ1Q9C009 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FOXQ1Q9C009 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FOXQ1Q9C009 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FOXQ1Q9C009 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FOXQ1Q9C009 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FOXQ1Q9C009 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FOXQ1Q9C009 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
FOXQ1Q9C009 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FOXQ1Q9C009 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FOXQ1Q9C009 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FOXQ1Q9C009 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FOXQ1Q9C009 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FOXQ1Q9C009 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FOXQ1Q9C009 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FOXQ1Q9C009 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FOXQ1Q9C009 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FOXQ1Q9C009 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
FOXQ1Q9C009 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FOXQ1Q9C009 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
FOXQ1Q9C009 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FOXQ1Q9C009 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FOXQ1Q9C009 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FOXQ1Q9C009 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FOXQ1Q9C009 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FOXQ1Q9C009 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.99
FOXQ1Q9C009 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FOXQ1Q9C009 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FOXQ1Q9C009 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FOXQ1Q9C009 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FOXQ1Q9C009 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
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FOXQ1Q9C009 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
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FOXQ1Q9C009 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
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FOXQ1Q9C009 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
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FOXQ1Q9C009 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FOXQ1Q9C009 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
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FOXQ1Q9C009 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FOXQ1Q9C009 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FOXQ1Q9C009 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FOXQ1Q9C009 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FOXQ1Q9C009 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FOXQ1Q9C009 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FOXQ1Q9C009 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FOXQ1Q9C009 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FOXQ1Q9C009 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FOXQ1Q9C009 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FOXQ1Q9C009 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FOXQ1Q9C009 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FOXQ1Q9C009 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
FOXQ1Q9C009 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
FOXQ1Q9C009 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FOXQ1Q9C009 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
FOXQ1Q9C009 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FOXQ1Q9C009 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FOXQ1Q9C009 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
FOXQ1Q9C009 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FOXQ1Q9C009 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FOXQ1Q9C009 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
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