Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZ95

NSD3, Histone-lysine N-methyltransferase NSD3, humanhuman

Predictions only

Length 1,437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSD3Q9BZ95 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
NSD3Q9BZ95 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NSD3Q9BZ95 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NSD3Q9BZ95 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NSD3Q9BZ95 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NSD3Q9BZ95 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NSD3Q9BZ95 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NSD3Q9BZ95 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NSD3Q9BZ95 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
NSD3Q9BZ95 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC28.53■■■□□ 2.16
NSD3Q9BZ95 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NSD3Q9BZ95 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
NSD3Q9BZ95 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NSD3Q9BZ95 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NSD3Q9BZ95 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
NSD3Q9BZ95 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
NSD3Q9BZ95 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NSD3Q9BZ95 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NSD3Q9BZ95 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NSD3Q9BZ95 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
NSD3Q9BZ95 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
NSD3Q9BZ95 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
NSD3Q9BZ95 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
NSD3Q9BZ95 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
NSD3Q9BZ95 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
NSD3Q9BZ95 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
NSD3Q9BZ95 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
NSD3Q9BZ95 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
NSD3Q9BZ95 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
NSD3Q9BZ95 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NSD3Q9BZ95 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
NSD3Q9BZ95 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NSD3Q9BZ95 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
NSD3Q9BZ95 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
NSD3Q9BZ95 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
NSD3Q9BZ95 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
NSD3Q9BZ95 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
NSD3Q9BZ95 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NSD3Q9BZ95 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
NSD3Q9BZ95 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NSD3Q9BZ95 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
NSD3Q9BZ95 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NSD3Q9BZ95 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NSD3Q9BZ95 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
NSD3Q9BZ95 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
NSD3Q9BZ95 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
NSD3Q9BZ95 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
NSD3Q9BZ95 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NSD3Q9BZ95 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NSD3Q9BZ95 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NSD3Q9BZ95 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
NSD3Q9BZ95 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NSD3Q9BZ95 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NSD3Q9BZ95 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
NSD3Q9BZ95 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NSD3Q9BZ95 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
NSD3Q9BZ95 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
NSD3Q9BZ95 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
NSD3Q9BZ95 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
NSD3Q9BZ95 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NSD3Q9BZ95 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
NSD3Q9BZ95 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NSD3Q9BZ95 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
NSD3Q9BZ95 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NSD3Q9BZ95 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
NSD3Q9BZ95 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NSD3Q9BZ95 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
NSD3Q9BZ95 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NSD3Q9BZ95 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NSD3Q9BZ95 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
NSD3Q9BZ95 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
NSD3Q9BZ95 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
NSD3Q9BZ95 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
NSD3Q9BZ95 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
NSD3Q9BZ95 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NSD3Q9BZ95 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NSD3Q9BZ95 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
NSD3Q9BZ95 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NSD3Q9BZ95 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
NSD3Q9BZ95 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
NSD3Q9BZ95 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NSD3Q9BZ95 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NSD3Q9BZ95 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
NSD3Q9BZ95 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
NSD3Q9BZ95 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
NSD3Q9BZ95 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
NSD3Q9BZ95 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
NSD3Q9BZ95 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
NSD3Q9BZ95 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
NSD3Q9BZ95 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
NSD3Q9BZ95 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
NSD3Q9BZ95 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
NSD3Q9BZ95 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
NSD3Q9BZ95 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
NSD3Q9BZ95 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
NSD3Q9BZ95 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
NSD3Q9BZ95 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NSD3Q9BZ95 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
NSD3Q9BZ95 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
NSD3Q9BZ95 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms