Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYX4

IFIH1, Interferon-induced helicase C domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,025 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFIH1Q9BYX4 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IFIH1Q9BYX4 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
IFIH1Q9BYX4 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
IFIH1Q9BYX4 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IFIH1Q9BYX4 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
IFIH1Q9BYX4 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
IFIH1Q9BYX4 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
IFIH1Q9BYX4 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
IFIH1Q9BYX4 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
IFIH1Q9BYX4 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
IFIH1Q9BYX4 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IFIH1Q9BYX4 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
IFIH1Q9BYX4 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IFIH1Q9BYX4 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IFIH1Q9BYX4 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IFIH1Q9BYX4 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
IFIH1Q9BYX4 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IFIH1Q9BYX4 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IFIH1Q9BYX4 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
IFIH1Q9BYX4 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
IFIH1Q9BYX4 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
IFIH1Q9BYX4 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
IFIH1Q9BYX4 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IFIH1Q9BYX4 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
IFIH1Q9BYX4 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
IFIH1Q9BYX4 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
IFIH1Q9BYX4 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
IFIH1Q9BYX4 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
IFIH1Q9BYX4 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IFIH1Q9BYX4 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
IFIH1Q9BYX4 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
IFIH1Q9BYX4 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IFIH1Q9BYX4 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
IFIH1Q9BYX4 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
IFIH1Q9BYX4 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IFIH1Q9BYX4 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IFIH1Q9BYX4 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IFIH1Q9BYX4 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IFIH1Q9BYX4 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IFIH1Q9BYX4 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
IFIH1Q9BYX4 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
IFIH1Q9BYX4 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IFIH1Q9BYX4 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
IFIH1Q9BYX4 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
IFIH1Q9BYX4 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
IFIH1Q9BYX4 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IFIH1Q9BYX4 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IFIH1Q9BYX4 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
IFIH1Q9BYX4 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
IFIH1Q9BYX4 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
IFIH1Q9BYX4 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
IFIH1Q9BYX4 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
IFIH1Q9BYX4 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
IFIH1Q9BYX4 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
IFIH1Q9BYX4 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
IFIH1Q9BYX4 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
IFIH1Q9BYX4 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
IFIH1Q9BYX4 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
IFIH1Q9BYX4 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
IFIH1Q9BYX4 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
IFIH1Q9BYX4 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
IFIH1Q9BYX4 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
IFIH1Q9BYX4 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
IFIH1Q9BYX4 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
IFIH1Q9BYX4 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
IFIH1Q9BYX4 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
IFIH1Q9BYX4 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
IFIH1Q9BYX4 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
IFIH1Q9BYX4 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
IFIH1Q9BYX4 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
IFIH1Q9BYX4 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
IFIH1Q9BYX4 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
IFIH1Q9BYX4 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
IFIH1Q9BYX4 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
IFIH1Q9BYX4 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
IFIH1Q9BYX4 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
IFIH1Q9BYX4 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
IFIH1Q9BYX4 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
IFIH1Q9BYX4 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
IFIH1Q9BYX4 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
IFIH1Q9BYX4 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
IFIH1Q9BYX4 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
IFIH1Q9BYX4 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
IFIH1Q9BYX4 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
IFIH1Q9BYX4 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
IFIH1Q9BYX4 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
IFIH1Q9BYX4 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
IFIH1Q9BYX4 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
IFIH1Q9BYX4 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
IFIH1Q9BYX4 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
IFIH1Q9BYX4 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
IFIH1Q9BYX4 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
IFIH1Q9BYX4 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
IFIH1Q9BYX4 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
IFIH1Q9BYX4 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
IFIH1Q9BYX4 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
IFIH1Q9BYX4 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
IFIH1Q9BYX4 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
IFIH1Q9BYX4 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
IFIH1Q9BYX4 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms