Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY07

SLC4A5, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A5Q9BY07 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC4A5Q9BY07 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC4A5Q9BY07 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC4A5Q9BY07 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC4A5Q9BY07 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC4A5Q9BY07 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC4A5Q9BY07 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC4A5Q9BY07 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC4A5Q9BY07 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC4A5Q9BY07 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC4A5Q9BY07 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC4A5Q9BY07 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC4A5Q9BY07 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC4A5Q9BY07 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SLC4A5Q9BY07 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC4A5Q9BY07 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC4A5Q9BY07 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC4A5Q9BY07 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC4A5Q9BY07 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC4A5Q9BY07 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC4A5Q9BY07 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC4A5Q9BY07 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC4A5Q9BY07 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SLC4A5Q9BY07 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC4A5Q9BY07 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC4A5Q9BY07 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC4A5Q9BY07 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC4A5Q9BY07 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC4A5Q9BY07 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC4A5Q9BY07 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC4A5Q9BY07 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC4A5Q9BY07 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SLC4A5Q9BY07 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC4A5Q9BY07 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC4A5Q9BY07 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC4A5Q9BY07 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC4A5Q9BY07 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC4A5Q9BY07 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC4A5Q9BY07 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC4A5Q9BY07 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC4A5Q9BY07 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC4A5Q9BY07 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC4A5Q9BY07 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC4A5Q9BY07 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC4A5Q9BY07 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC4A5Q9BY07 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC4A5Q9BY07 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC4A5Q9BY07 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC4A5Q9BY07 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC4A5Q9BY07 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC4A5Q9BY07 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC4A5Q9BY07 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC4A5Q9BY07 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC4A5Q9BY07 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC4A5Q9BY07 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC4A5Q9BY07 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC4A5Q9BY07 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC4A5Q9BY07 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC4A5Q9BY07 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC4A5Q9BY07 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC4A5Q9BY07 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC4A5Q9BY07 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC4A5Q9BY07 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC4A5Q9BY07 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC4A5Q9BY07 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC4A5Q9BY07 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SLC4A5Q9BY07 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC4A5Q9BY07 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC4A5Q9BY07 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC4A5Q9BY07 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC4A5Q9BY07 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC4A5Q9BY07 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC4A5Q9BY07 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC4A5Q9BY07 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC4A5Q9BY07 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC4A5Q9BY07 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SLC4A5Q9BY07 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC4A5Q9BY07 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC4A5Q9BY07 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC4A5Q9BY07 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC4A5Q9BY07 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC4A5Q9BY07 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC4A5Q9BY07 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC4A5Q9BY07 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC4A5Q9BY07 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC4A5Q9BY07 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC4A5Q9BY07 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC4A5Q9BY07 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC4A5Q9BY07 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC4A5Q9BY07 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC4A5Q9BY07 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC4A5Q9BY07 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC4A5Q9BY07 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC4A5Q9BY07 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC4A5Q9BY07 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC4A5Q9BY07 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC4A5Q9BY07 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SLC4A5Q9BY07 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC4A5Q9BY07 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SLC4A5Q9BY07 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms