Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVG9

PTDSS2, Phosphatidylserine synthase 2, humanhuman

Predictions only

Length 487 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS2Q9BVG9 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTDSS2Q9BVG9 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTDSS2Q9BVG9 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTDSS2Q9BVG9 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTDSS2Q9BVG9 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTDSS2Q9BVG9 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTDSS2Q9BVG9 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
PTDSS2Q9BVG9 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTDSS2Q9BVG9 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTDSS2Q9BVG9 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTDSS2Q9BVG9 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTDSS2Q9BVG9 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTDSS2Q9BVG9 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTDSS2Q9BVG9 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTDSS2Q9BVG9 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTDSS2Q9BVG9 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTDSS2Q9BVG9 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTDSS2Q9BVG9 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTDSS2Q9BVG9 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTDSS2Q9BVG9 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTDSS2Q9BVG9 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTDSS2Q9BVG9 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PTDSS2Q9BVG9 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTDSS2Q9BVG9 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTDSS2Q9BVG9 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTDSS2Q9BVG9 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTDSS2Q9BVG9 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTDSS2Q9BVG9 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTDSS2Q9BVG9 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTDSS2Q9BVG9 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTDSS2Q9BVG9 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTDSS2Q9BVG9 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTDSS2Q9BVG9 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTDSS2Q9BVG9 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTDSS2Q9BVG9 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTDSS2Q9BVG9 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTDSS2Q9BVG9 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTDSS2Q9BVG9 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTDSS2Q9BVG9 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTDSS2Q9BVG9 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTDSS2Q9BVG9 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTDSS2Q9BVG9 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTDSS2Q9BVG9 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTDSS2Q9BVG9 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTDSS2Q9BVG9 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PTDSS2Q9BVG9 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTDSS2Q9BVG9 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTDSS2Q9BVG9 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTDSS2Q9BVG9 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTDSS2Q9BVG9 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTDSS2Q9BVG9 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTDSS2Q9BVG9 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTDSS2Q9BVG9 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTDSS2Q9BVG9 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTDSS2Q9BVG9 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTDSS2Q9BVG9 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTDSS2Q9BVG9 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTDSS2Q9BVG9 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTDSS2Q9BVG9 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTDSS2Q9BVG9 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTDSS2Q9BVG9 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTDSS2Q9BVG9 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
PTDSS2Q9BVG9 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTDSS2Q9BVG9 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTDSS2Q9BVG9 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTDSS2Q9BVG9 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
PTDSS2Q9BVG9 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
PTDSS2Q9BVG9 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTDSS2Q9BVG9 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTDSS2Q9BVG9 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTDSS2Q9BVG9 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTDSS2Q9BVG9 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTDSS2Q9BVG9 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTDSS2Q9BVG9 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTDSS2Q9BVG9 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PTDSS2Q9BVG9 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTDSS2Q9BVG9 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTDSS2Q9BVG9 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTDSS2Q9BVG9 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTDSS2Q9BVG9 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
PTDSS2Q9BVG9 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTDSS2Q9BVG9 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
PTDSS2Q9BVG9 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTDSS2Q9BVG9 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTDSS2Q9BVG9 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTDSS2Q9BVG9 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTDSS2Q9BVG9 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTDSS2Q9BVG9 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTDSS2Q9BVG9 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTDSS2Q9BVG9 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTDSS2Q9BVG9 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
PTDSS2Q9BVG9 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTDSS2Q9BVG9 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTDSS2Q9BVG9 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTDSS2Q9BVG9 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PTDSS2Q9BVG9 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
PTDSS2Q9BVG9 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
PTDSS2Q9BVG9 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
PTDSS2Q9BVG9 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
PTDSS2Q9BVG9 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms