Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVG4

PBDC1, Protein PBDC1, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBDC1Q9BVG4 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PBDC1Q9BVG4 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PBDC1Q9BVG4 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PBDC1Q9BVG4 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PBDC1Q9BVG4 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PBDC1Q9BVG4 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PBDC1Q9BVG4 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PBDC1Q9BVG4 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PBDC1Q9BVG4 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PBDC1Q9BVG4 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PBDC1Q9BVG4 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PBDC1Q9BVG4 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PBDC1Q9BVG4 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PBDC1Q9BVG4 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PBDC1Q9BVG4 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PBDC1Q9BVG4 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PBDC1Q9BVG4 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PBDC1Q9BVG4 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PBDC1Q9BVG4 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PBDC1Q9BVG4 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PBDC1Q9BVG4 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PBDC1Q9BVG4 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PBDC1Q9BVG4 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PBDC1Q9BVG4 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PBDC1Q9BVG4 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PBDC1Q9BVG4 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PBDC1Q9BVG4 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PBDC1Q9BVG4 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PBDC1Q9BVG4 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PBDC1Q9BVG4 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PBDC1Q9BVG4 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PBDC1Q9BVG4 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PBDC1Q9BVG4 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PBDC1Q9BVG4 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PBDC1Q9BVG4 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PBDC1Q9BVG4 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PBDC1Q9BVG4 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PBDC1Q9BVG4 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PBDC1Q9BVG4 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PBDC1Q9BVG4 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PBDC1Q9BVG4 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PBDC1Q9BVG4 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PBDC1Q9BVG4 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PBDC1Q9BVG4 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PBDC1Q9BVG4 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PBDC1Q9BVG4 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PBDC1Q9BVG4 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PBDC1Q9BVG4 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PBDC1Q9BVG4 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PBDC1Q9BVG4 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PBDC1Q9BVG4 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PBDC1Q9BVG4 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PBDC1Q9BVG4 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PBDC1Q9BVG4 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PBDC1Q9BVG4 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PBDC1Q9BVG4 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PBDC1Q9BVG4 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PBDC1Q9BVG4 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PBDC1Q9BVG4 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PBDC1Q9BVG4 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PBDC1Q9BVG4 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PBDC1Q9BVG4 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PBDC1Q9BVG4 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PBDC1Q9BVG4 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PBDC1Q9BVG4 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PBDC1Q9BVG4 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PBDC1Q9BVG4 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PBDC1Q9BVG4 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PBDC1Q9BVG4 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PBDC1Q9BVG4 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PBDC1Q9BVG4 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PBDC1Q9BVG4 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PBDC1Q9BVG4 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PBDC1Q9BVG4 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PBDC1Q9BVG4 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
PBDC1Q9BVG4 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PBDC1Q9BVG4 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PBDC1Q9BVG4 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PBDC1Q9BVG4 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PBDC1Q9BVG4 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PBDC1Q9BVG4 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PBDC1Q9BVG4 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PBDC1Q9BVG4 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PBDC1Q9BVG4 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
PBDC1Q9BVG4 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PBDC1Q9BVG4 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PBDC1Q9BVG4 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PBDC1Q9BVG4 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PBDC1Q9BVG4 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PBDC1Q9BVG4 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PBDC1Q9BVG4 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PBDC1Q9BVG4 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PBDC1Q9BVG4 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PBDC1Q9BVG4 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PBDC1Q9BVG4 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PBDC1Q9BVG4 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PBDC1Q9BVG4 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PBDC1Q9BVG4 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PBDC1Q9BVG4 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PBDC1Q9BVG4 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms