Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT78

COPS4, COP9 signalosome complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS4Q9BT78 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
COPS4Q9BT78 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
COPS4Q9BT78 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
COPS4Q9BT78 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
COPS4Q9BT78 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
COPS4Q9BT78 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
COPS4Q9BT78 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
COPS4Q9BT78 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
COPS4Q9BT78 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
COPS4Q9BT78 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
COPS4Q9BT78 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
COPS4Q9BT78 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
COPS4Q9BT78 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
COPS4Q9BT78 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
COPS4Q9BT78 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
COPS4Q9BT78 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
COPS4Q9BT78 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
COPS4Q9BT78 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
COPS4Q9BT78 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
COPS4Q9BT78 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
COPS4Q9BT78 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
COPS4Q9BT78 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
COPS4Q9BT78 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
COPS4Q9BT78 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
COPS4Q9BT78 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
COPS4Q9BT78 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
COPS4Q9BT78 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
COPS4Q9BT78 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
COPS4Q9BT78 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
COPS4Q9BT78 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
COPS4Q9BT78 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
COPS4Q9BT78 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
COPS4Q9BT78 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
COPS4Q9BT78 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
COPS4Q9BT78 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
COPS4Q9BT78 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
COPS4Q9BT78 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
COPS4Q9BT78 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
COPS4Q9BT78 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
COPS4Q9BT78 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
COPS4Q9BT78 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
COPS4Q9BT78 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
COPS4Q9BT78 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
COPS4Q9BT78 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
COPS4Q9BT78 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
COPS4Q9BT78 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
COPS4Q9BT78 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
COPS4Q9BT78 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
COPS4Q9BT78 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
COPS4Q9BT78 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
COPS4Q9BT78 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
COPS4Q9BT78 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
COPS4Q9BT78 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
COPS4Q9BT78 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
COPS4Q9BT78 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
COPS4Q9BT78 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
COPS4Q9BT78 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
COPS4Q9BT78 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
COPS4Q9BT78 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
COPS4Q9BT78 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
COPS4Q9BT78 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
COPS4Q9BT78 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
COPS4Q9BT78 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
COPS4Q9BT78 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
COPS4Q9BT78 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
COPS4Q9BT78 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
COPS4Q9BT78 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
COPS4Q9BT78 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
COPS4Q9BT78 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
COPS4Q9BT78 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
COPS4Q9BT78 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
COPS4Q9BT78 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
COPS4Q9BT78 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
COPS4Q9BT78 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
COPS4Q9BT78 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
COPS4Q9BT78 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
COPS4Q9BT78 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
COPS4Q9BT78 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
COPS4Q9BT78 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
COPS4Q9BT78 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
COPS4Q9BT78 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
COPS4Q9BT78 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
COPS4Q9BT78 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
COPS4Q9BT78 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
COPS4Q9BT78 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
COPS4Q9BT78 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
COPS4Q9BT78 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
COPS4Q9BT78 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
COPS4Q9BT78 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
COPS4Q9BT78 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
COPS4Q9BT78 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
COPS4Q9BT78 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
COPS4Q9BT78 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
COPS4Q9BT78 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
COPS4Q9BT78 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
COPS4Q9BT78 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
COPS4Q9BT78 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
COPS4Q9BT78 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
COPS4Q9BT78 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
COPS4Q9BT78 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms