Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRY0

SLC39A3, Zinc transporter ZIP3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A3Q9BRY0 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLC39A3Q9BRY0 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLC39A3Q9BRY0 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SLC39A3Q9BRY0 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC39A3Q9BRY0 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC39A3Q9BRY0 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC39A3Q9BRY0 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC39A3Q9BRY0 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC39A3Q9BRY0 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC39A3Q9BRY0 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC39A3Q9BRY0 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC39A3Q9BRY0 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC39A3Q9BRY0 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC39A3Q9BRY0 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC39A3Q9BRY0 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC39A3Q9BRY0 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC39A3Q9BRY0 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC39A3Q9BRY0 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC39A3Q9BRY0 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC39A3Q9BRY0 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SLC39A3Q9BRY0 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLC39A3Q9BRY0 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLC39A3Q9BRY0 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLC39A3Q9BRY0 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLC39A3Q9BRY0 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLC39A3Q9BRY0 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLC39A3Q9BRY0 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLC39A3Q9BRY0 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
SLC39A3Q9BRY0 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLC39A3Q9BRY0 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLC39A3Q9BRY0 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SLC39A3Q9BRY0 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SLC39A3Q9BRY0 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
SLC39A3Q9BRY0 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
SLC39A3Q9BRY0 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SLC39A3Q9BRY0 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
SLC39A3Q9BRY0 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC39A3Q9BRY0 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC39A3Q9BRY0 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC39A3Q9BRY0 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC39A3Q9BRY0 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC39A3Q9BRY0 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC39A3Q9BRY0 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC39A3Q9BRY0 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC39A3Q9BRY0 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC39A3Q9BRY0 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC39A3Q9BRY0 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC39A3Q9BRY0 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC39A3Q9BRY0 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC39A3Q9BRY0 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC39A3Q9BRY0 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC39A3Q9BRY0 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC39A3Q9BRY0 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC39A3Q9BRY0 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC39A3Q9BRY0 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC39A3Q9BRY0 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC39A3Q9BRY0 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SLC39A3Q9BRY0 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
SLC39A3Q9BRY0 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SLC39A3Q9BRY0 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SLC39A3Q9BRY0 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SLC39A3Q9BRY0 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SLC39A3Q9BRY0 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SLC39A3Q9BRY0 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SLC39A3Q9BRY0 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SLC39A3Q9BRY0 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SLC39A3Q9BRY0 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
SLC39A3Q9BRY0 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SLC39A3Q9BRY0 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC20■□□□□ 0.79
SLC39A3Q9BRY0 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC20■□□□□ 0.79
SLC39A3Q9BRY0 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SLC39A3Q9BRY0 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SLC39A3Q9BRY0 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SLC39A3Q9BRY0 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
SLC39A3Q9BRY0 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
SLC39A3Q9BRY0 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
SLC39A3Q9BRY0 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SLC39A3Q9BRY0 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SLC39A3Q9BRY0 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SLC39A3Q9BRY0 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SLC39A3Q9BRY0 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SLC39A3Q9BRY0 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
SLC39A3Q9BRY0 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC39A3Q9BRY0 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC39A3Q9BRY0 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC39A3Q9BRY0 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC39A3Q9BRY0 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC39A3Q9BRY0 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC39A3Q9BRY0 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC39A3Q9BRY0 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC39A3Q9BRY0 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC39A3Q9BRY0 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC39A3Q9BRY0 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC39A3Q9BRY0 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC39A3Q9BRY0 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC39A3Q9BRY0 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SLC39A3Q9BRY0 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC39A3Q9BRY0 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC39A3Q9BRY0 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SLC39A3Q9BRY0 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms