Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRV8

SIKE1, Suppressor of IKBKE 1, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIKE1Q9BRV8 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SIKE1Q9BRV8 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SIKE1Q9BRV8 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SIKE1Q9BRV8 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SIKE1Q9BRV8 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SIKE1Q9BRV8 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SIKE1Q9BRV8 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
SIKE1Q9BRV8 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SIKE1Q9BRV8 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
SIKE1Q9BRV8 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
SIKE1Q9BRV8 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
SIKE1Q9BRV8 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
SIKE1Q9BRV8 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SIKE1Q9BRV8 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SIKE1Q9BRV8 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SIKE1Q9BRV8 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SIKE1Q9BRV8 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SIKE1Q9BRV8 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SIKE1Q9BRV8 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SIKE1Q9BRV8 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SIKE1Q9BRV8 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SIKE1Q9BRV8 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SIKE1Q9BRV8 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SIKE1Q9BRV8 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SIKE1Q9BRV8 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SIKE1Q9BRV8 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SIKE1Q9BRV8 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SIKE1Q9BRV8 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SIKE1Q9BRV8 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SIKE1Q9BRV8 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SIKE1Q9BRV8 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SIKE1Q9BRV8 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SIKE1Q9BRV8 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
SIKE1Q9BRV8 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SIKE1Q9BRV8 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SIKE1Q9BRV8 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SIKE1Q9BRV8 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SIKE1Q9BRV8 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SIKE1Q9BRV8 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SIKE1Q9BRV8 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SIKE1Q9BRV8 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SIKE1Q9BRV8 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SIKE1Q9BRV8 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SIKE1Q9BRV8 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SIKE1Q9BRV8 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SIKE1Q9BRV8 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SIKE1Q9BRV8 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SIKE1Q9BRV8 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
SIKE1Q9BRV8 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SIKE1Q9BRV8 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SIKE1Q9BRV8 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
SIKE1Q9BRV8 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SIKE1Q9BRV8 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SIKE1Q9BRV8 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SIKE1Q9BRV8 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SIKE1Q9BRV8 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SIKE1Q9BRV8 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SIKE1Q9BRV8 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SIKE1Q9BRV8 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SIKE1Q9BRV8 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SIKE1Q9BRV8 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SIKE1Q9BRV8 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SIKE1Q9BRV8 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SIKE1Q9BRV8 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SIKE1Q9BRV8 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SIKE1Q9BRV8 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SIKE1Q9BRV8 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SIKE1Q9BRV8 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SIKE1Q9BRV8 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SIKE1Q9BRV8 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SIKE1Q9BRV8 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SIKE1Q9BRV8 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SIKE1Q9BRV8 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SIKE1Q9BRV8 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SIKE1Q9BRV8 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SIKE1Q9BRV8 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SIKE1Q9BRV8 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SIKE1Q9BRV8 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SIKE1Q9BRV8 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SIKE1Q9BRV8 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SIKE1Q9BRV8 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SIKE1Q9BRV8 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SIKE1Q9BRV8 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SIKE1Q9BRV8 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SIKE1Q9BRV8 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SIKE1Q9BRV8 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SIKE1Q9BRV8 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SIKE1Q9BRV8 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SIKE1Q9BRV8 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SIKE1Q9BRV8 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SIKE1Q9BRV8 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SIKE1Q9BRV8 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SIKE1Q9BRV8 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SIKE1Q9BRV8 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SIKE1Q9BRV8 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SIKE1Q9BRV8 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SIKE1Q9BRV8 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SIKE1Q9BRV8 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SIKE1Q9BRV8 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SIKE1Q9BRV8 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms