Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRN9

TM2D3, TM2 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM2D3Q9BRN9 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TM2D3Q9BRN9 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TM2D3Q9BRN9 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TM2D3Q9BRN9 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
TM2D3Q9BRN9 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TM2D3Q9BRN9 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TM2D3Q9BRN9 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
TM2D3Q9BRN9 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TM2D3Q9BRN9 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
TM2D3Q9BRN9 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TM2D3Q9BRN9 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TM2D3Q9BRN9 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TM2D3Q9BRN9 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TM2D3Q9BRN9 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TM2D3Q9BRN9 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TM2D3Q9BRN9 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TM2D3Q9BRN9 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TM2D3Q9BRN9 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TM2D3Q9BRN9 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TM2D3Q9BRN9 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TM2D3Q9BRN9 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TM2D3Q9BRN9 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TM2D3Q9BRN9 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TM2D3Q9BRN9 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TM2D3Q9BRN9 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TM2D3Q9BRN9 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TM2D3Q9BRN9 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TM2D3Q9BRN9 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TM2D3Q9BRN9 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TM2D3Q9BRN9 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TM2D3Q9BRN9 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
TM2D3Q9BRN9 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
TM2D3Q9BRN9 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TM2D3Q9BRN9 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TM2D3Q9BRN9 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TM2D3Q9BRN9 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TM2D3Q9BRN9 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TM2D3Q9BRN9 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TM2D3Q9BRN9 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TM2D3Q9BRN9 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TM2D3Q9BRN9 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TM2D3Q9BRN9 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TM2D3Q9BRN9 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TM2D3Q9BRN9 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TM2D3Q9BRN9 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TM2D3Q9BRN9 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TM2D3Q9BRN9 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TM2D3Q9BRN9 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TM2D3Q9BRN9 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TM2D3Q9BRN9 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TM2D3Q9BRN9 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TM2D3Q9BRN9 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TM2D3Q9BRN9 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TM2D3Q9BRN9 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TM2D3Q9BRN9 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TM2D3Q9BRN9 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TM2D3Q9BRN9 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TM2D3Q9BRN9 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TM2D3Q9BRN9 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TM2D3Q9BRN9 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TM2D3Q9BRN9 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TM2D3Q9BRN9 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TM2D3Q9BRN9 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TM2D3Q9BRN9 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TM2D3Q9BRN9 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TM2D3Q9BRN9 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TM2D3Q9BRN9 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TM2D3Q9BRN9 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TM2D3Q9BRN9 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TM2D3Q9BRN9 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TM2D3Q9BRN9 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TM2D3Q9BRN9 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TM2D3Q9BRN9 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TM2D3Q9BRN9 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TM2D3Q9BRN9 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TM2D3Q9BRN9 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TM2D3Q9BRN9 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TM2D3Q9BRN9 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TM2D3Q9BRN9 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TM2D3Q9BRN9 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TM2D3Q9BRN9 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TM2D3Q9BRN9 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TM2D3Q9BRN9 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TM2D3Q9BRN9 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TM2D3Q9BRN9 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TM2D3Q9BRN9 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TM2D3Q9BRN9 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TM2D3Q9BRN9 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TM2D3Q9BRN9 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TM2D3Q9BRN9 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TM2D3Q9BRN9 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TM2D3Q9BRN9 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TM2D3Q9BRN9 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
TM2D3Q9BRN9 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TM2D3Q9BRN9 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TM2D3Q9BRN9 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TM2D3Q9BRN9 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TM2D3Q9BRN9 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TM2D3Q9BRN9 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TM2D3Q9BRN9 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms