Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ70

TCF25, Transcription factor 25, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF25Q9BQ70 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TCF25Q9BQ70 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TCF25Q9BQ70 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TCF25Q9BQ70 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TCF25Q9BQ70 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TCF25Q9BQ70 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TCF25Q9BQ70 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TCF25Q9BQ70 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TCF25Q9BQ70 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TCF25Q9BQ70 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TCF25Q9BQ70 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TCF25Q9BQ70 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TCF25Q9BQ70 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TCF25Q9BQ70 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TCF25Q9BQ70 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TCF25Q9BQ70 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TCF25Q9BQ70 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TCF25Q9BQ70 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TCF25Q9BQ70 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TCF25Q9BQ70 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TCF25Q9BQ70 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TCF25Q9BQ70 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TCF25Q9BQ70 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TCF25Q9BQ70 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TCF25Q9BQ70 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TCF25Q9BQ70 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TCF25Q9BQ70 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TCF25Q9BQ70 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TCF25Q9BQ70 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TCF25Q9BQ70 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TCF25Q9BQ70 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TCF25Q9BQ70 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TCF25Q9BQ70 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TCF25Q9BQ70 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TCF25Q9BQ70 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TCF25Q9BQ70 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TCF25Q9BQ70 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TCF25Q9BQ70 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TCF25Q9BQ70 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TCF25Q9BQ70 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TCF25Q9BQ70 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TCF25Q9BQ70 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TCF25Q9BQ70 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TCF25Q9BQ70 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TCF25Q9BQ70 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TCF25Q9BQ70 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TCF25Q9BQ70 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TCF25Q9BQ70 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TCF25Q9BQ70 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TCF25Q9BQ70 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TCF25Q9BQ70 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TCF25Q9BQ70 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TCF25Q9BQ70 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TCF25Q9BQ70 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TCF25Q9BQ70 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TCF25Q9BQ70 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TCF25Q9BQ70 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TCF25Q9BQ70 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TCF25Q9BQ70 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TCF25Q9BQ70 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TCF25Q9BQ70 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TCF25Q9BQ70 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TCF25Q9BQ70 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TCF25Q9BQ70 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TCF25Q9BQ70 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TCF25Q9BQ70 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TCF25Q9BQ70 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TCF25Q9BQ70 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TCF25Q9BQ70 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TCF25Q9BQ70 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TCF25Q9BQ70 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TCF25Q9BQ70 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TCF25Q9BQ70 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TCF25Q9BQ70 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TCF25Q9BQ70 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TCF25Q9BQ70 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TCF25Q9BQ70 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TCF25Q9BQ70 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TCF25Q9BQ70 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TCF25Q9BQ70 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TCF25Q9BQ70 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TCF25Q9BQ70 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TCF25Q9BQ70 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TCF25Q9BQ70 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TCF25Q9BQ70 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TCF25Q9BQ70 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TCF25Q9BQ70 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TCF25Q9BQ70 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TCF25Q9BQ70 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TCF25Q9BQ70 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TCF25Q9BQ70 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TCF25Q9BQ70 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TCF25Q9BQ70 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TCF25Q9BQ70 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TCF25Q9BQ70 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TCF25Q9BQ70 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TCF25Q9BQ70 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TCF25Q9BQ70 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TCF25Q9BQ70 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TCF25Q9BQ70 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms