Protein–RNA interactions for Protein: Q99708

RBBP8, DNA endonuclease RBBP8, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP8Q99708 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
RBBP8Q99708 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
RBBP8Q99708 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RBBP8Q99708 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RBBP8Q99708 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
RBBP8Q99708 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
RBBP8Q99708 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
RBBP8Q99708 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RBBP8Q99708 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RBBP8Q99708 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RBBP8Q99708 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RBBP8Q99708 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RBBP8Q99708 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RBBP8Q99708 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RBBP8Q99708 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RBBP8Q99708 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RBBP8Q99708 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RBBP8Q99708 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RBBP8Q99708 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RBBP8Q99708 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RBBP8Q99708 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RBBP8Q99708 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RBBP8Q99708 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RBBP8Q99708 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RBBP8Q99708 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
RBBP8Q99708 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
RBBP8Q99708 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RBBP8Q99708 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RBBP8Q99708 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RBBP8Q99708 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RBBP8Q99708 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RBBP8Q99708 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RBBP8Q99708 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
RBBP8Q99708 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RBBP8Q99708 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RBBP8Q99708 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RBBP8Q99708 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RBBP8Q99708 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RBBP8Q99708 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
RBBP8Q99708 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
RBBP8Q99708 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RBBP8Q99708 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RBBP8Q99708 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RBBP8Q99708 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RBBP8Q99708 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RBBP8Q99708 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RBBP8Q99708 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RBBP8Q99708 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RBBP8Q99708 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RBBP8Q99708 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RBBP8Q99708 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RBBP8Q99708 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
RBBP8Q99708 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RBBP8Q99708 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RBBP8Q99708 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RBBP8Q99708 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RBBP8Q99708 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RBBP8Q99708 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RBBP8Q99708 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
RBBP8Q99708 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RBBP8Q99708 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RBBP8Q99708 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RBBP8Q99708 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RBBP8Q99708 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RBBP8Q99708 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RBBP8Q99708 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RBBP8Q99708 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RBBP8Q99708 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RBBP8Q99708 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RBBP8Q99708 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RBBP8Q99708 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RBBP8Q99708 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RBBP8Q99708 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RBBP8Q99708 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RBBP8Q99708 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RBBP8Q99708 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RBBP8Q99708 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
RBBP8Q99708 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
RBBP8Q99708 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
RBBP8Q99708 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
RBBP8Q99708 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RBBP8Q99708 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RBBP8Q99708 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RBBP8Q99708 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RBBP8Q99708 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RBBP8Q99708 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RBBP8Q99708 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RBBP8Q99708 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RBBP8Q99708 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RBBP8Q99708 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RBBP8Q99708 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RBBP8Q99708 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RBBP8Q99708 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RBBP8Q99708 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
RBBP8Q99708 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RBBP8Q99708 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RBBP8Q99708 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
RBBP8Q99708 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
RBBP8Q99708 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
RBBP8Q99708 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms