Protein–RNA interactions for Protein: Q99504

EYA3, Eyes absent homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EYA3Q99504 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
EYA3Q99504 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
EYA3Q99504 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
EYA3Q99504 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
EYA3Q99504 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
EYA3Q99504 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
EYA3Q99504 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
EYA3Q99504 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
EYA3Q99504 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
EYA3Q99504 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
EYA3Q99504 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
EYA3Q99504 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
EYA3Q99504 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
EYA3Q99504 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
EYA3Q99504 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
EYA3Q99504 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
EYA3Q99504 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
EYA3Q99504 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
EYA3Q99504 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
EYA3Q99504 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
EYA3Q99504 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
EYA3Q99504 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
EYA3Q99504 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
EYA3Q99504 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
EYA3Q99504 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
EYA3Q99504 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
EYA3Q99504 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
EYA3Q99504 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
EYA3Q99504 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
EYA3Q99504 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
EYA3Q99504 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
EYA3Q99504 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
EYA3Q99504 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
EYA3Q99504 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
EYA3Q99504 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
EYA3Q99504 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
EYA3Q99504 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
EYA3Q99504 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
EYA3Q99504 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
EYA3Q99504 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
EYA3Q99504 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
EYA3Q99504 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
EYA3Q99504 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
EYA3Q99504 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
EYA3Q99504 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
EYA3Q99504 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
EYA3Q99504 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
EYA3Q99504 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
EYA3Q99504 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
EYA3Q99504 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
EYA3Q99504 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
EYA3Q99504 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
EYA3Q99504 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
EYA3Q99504 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
EYA3Q99504 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
EYA3Q99504 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
EYA3Q99504 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
EYA3Q99504 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
EYA3Q99504 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
EYA3Q99504 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
EYA3Q99504 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
EYA3Q99504 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
EYA3Q99504 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
EYA3Q99504 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
EYA3Q99504 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
EYA3Q99504 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
EYA3Q99504 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
EYA3Q99504 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
EYA3Q99504 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
EYA3Q99504 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
EYA3Q99504 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
EYA3Q99504 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
EYA3Q99504 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
EYA3Q99504 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
EYA3Q99504 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
EYA3Q99504 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
EYA3Q99504 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
EYA3Q99504 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
EYA3Q99504 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
EYA3Q99504 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
EYA3Q99504 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
EYA3Q99504 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
EYA3Q99504 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
EYA3Q99504 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
EYA3Q99504 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
EYA3Q99504 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
EYA3Q99504 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
EYA3Q99504 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
EYA3Q99504 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
EYA3Q99504 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
EYA3Q99504 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
EYA3Q99504 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
EYA3Q99504 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
EYA3Q99504 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
EYA3Q99504 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
EYA3Q99504 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
EYA3Q99504 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
EYA3Q99504 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
EYA3Q99504 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
EYA3Q99504 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms