Protein–RNA interactions for Protein: Q96T88

UHRF1, E3 ubiquitin-protein ligase UHRF1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UHRF1Q96T88 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UHRF1Q96T88 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UHRF1Q96T88 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UHRF1Q96T88 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UHRF1Q96T88 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UHRF1Q96T88 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UHRF1Q96T88 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UHRF1Q96T88 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
UHRF1Q96T88 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UHRF1Q96T88 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UHRF1Q96T88 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
UHRF1Q96T88 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
UHRF1Q96T88 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
UHRF1Q96T88 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UHRF1Q96T88 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UHRF1Q96T88 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UHRF1Q96T88 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UHRF1Q96T88 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
UHRF1Q96T88 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UHRF1Q96T88 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
UHRF1Q96T88 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UHRF1Q96T88 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
UHRF1Q96T88 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
UHRF1Q96T88 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
UHRF1Q96T88 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
UHRF1Q96T88 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
UHRF1Q96T88 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
UHRF1Q96T88 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
UHRF1Q96T88 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
UHRF1Q96T88 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UHRF1Q96T88 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UHRF1Q96T88 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UHRF1Q96T88 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UHRF1Q96T88 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UHRF1Q96T88 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
UHRF1Q96T88 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
UHRF1Q96T88 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
UHRF1Q96T88 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UHRF1Q96T88 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UHRF1Q96T88 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UHRF1Q96T88 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
UHRF1Q96T88 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
UHRF1Q96T88 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
UHRF1Q96T88 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
UHRF1Q96T88 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
UHRF1Q96T88 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
UHRF1Q96T88 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
UHRF1Q96T88 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
UHRF1Q96T88 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
UHRF1Q96T88 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
UHRF1Q96T88 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
UHRF1Q96T88 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
UHRF1Q96T88 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
UHRF1Q96T88 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
UHRF1Q96T88 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
UHRF1Q96T88 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
UHRF1Q96T88 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UHRF1Q96T88 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UHRF1Q96T88 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UHRF1Q96T88 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UHRF1Q96T88 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UHRF1Q96T88 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UHRF1Q96T88 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UHRF1Q96T88 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UHRF1Q96T88 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UHRF1Q96T88 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UHRF1Q96T88 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UHRF1Q96T88 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UHRF1Q96T88 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UHRF1Q96T88 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
UHRF1Q96T88 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
UHRF1Q96T88 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UHRF1Q96T88 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UHRF1Q96T88 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UHRF1Q96T88 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UHRF1Q96T88 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UHRF1Q96T88 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UHRF1Q96T88 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UHRF1Q96T88 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UHRF1Q96T88 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UHRF1Q96T88 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UHRF1Q96T88 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UHRF1Q96T88 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UHRF1Q96T88 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UHRF1Q96T88 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
UHRF1Q96T88 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UHRF1Q96T88 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
UHRF1Q96T88 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
UHRF1Q96T88 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UHRF1Q96T88 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UHRF1Q96T88 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
UHRF1Q96T88 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UHRF1Q96T88 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UHRF1Q96T88 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
UHRF1Q96T88 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UHRF1Q96T88 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
UHRF1Q96T88 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UHRF1Q96T88 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UHRF1Q96T88 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
UHRF1Q96T88 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms