Protein–RNA interactions for Protein: Q96SB3

PPP1R9B, Neurabin-2, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R9BQ96SB3 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PPP1R9BQ96SB3 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PPP1R9BQ96SB3 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PPP1R9BQ96SB3 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PPP1R9BQ96SB3 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PPP1R9BQ96SB3 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PPP1R9BQ96SB3 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PPP1R9BQ96SB3 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PPP1R9BQ96SB3 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PPP1R9BQ96SB3 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PPP1R9BQ96SB3 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PPP1R9BQ96SB3 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PPP1R9BQ96SB3 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PPP1R9BQ96SB3 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PPP1R9BQ96SB3 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PPP1R9BQ96SB3 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PPP1R9BQ96SB3 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PPP1R9BQ96SB3 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PPP1R9BQ96SB3 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PPP1R9BQ96SB3 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PPP1R9BQ96SB3 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PPP1R9BQ96SB3 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PPP1R9BQ96SB3 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PPP1R9BQ96SB3 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PPP1R9BQ96SB3 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PPP1R9BQ96SB3 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PPP1R9BQ96SB3 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PPP1R9BQ96SB3 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PPP1R9BQ96SB3 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PPP1R9BQ96SB3 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PPP1R9BQ96SB3 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PPP1R9BQ96SB3 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PPP1R9BQ96SB3 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PPP1R9BQ96SB3 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PPP1R9BQ96SB3 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PPP1R9BQ96SB3 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PPP1R9BQ96SB3 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PPP1R9BQ96SB3 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PPP1R9BQ96SB3 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PPP1R9BQ96SB3 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PPP1R9BQ96SB3 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PPP1R9BQ96SB3 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PPP1R9BQ96SB3 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PPP1R9BQ96SB3 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PPP1R9BQ96SB3 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PPP1R9BQ96SB3 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PPP1R9BQ96SB3 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PPP1R9BQ96SB3 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PPP1R9BQ96SB3 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PPP1R9BQ96SB3 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PPP1R9BQ96SB3 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PPP1R9BQ96SB3 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PPP1R9BQ96SB3 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PPP1R9BQ96SB3 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PPP1R9BQ96SB3 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PPP1R9BQ96SB3 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PPP1R9BQ96SB3 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PPP1R9BQ96SB3 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PPP1R9BQ96SB3 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PPP1R9BQ96SB3 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PPP1R9BQ96SB3 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PPP1R9BQ96SB3 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PPP1R9BQ96SB3 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PPP1R9BQ96SB3 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PPP1R9BQ96SB3 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PPP1R9BQ96SB3 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PPP1R9BQ96SB3 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PPP1R9BQ96SB3 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PPP1R9BQ96SB3 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PPP1R9BQ96SB3 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PPP1R9BQ96SB3 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PPP1R9BQ96SB3 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PPP1R9BQ96SB3 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PPP1R9BQ96SB3 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PPP1R9BQ96SB3 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PPP1R9BQ96SB3 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PPP1R9BQ96SB3 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PPP1R9BQ96SB3 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PPP1R9BQ96SB3 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PPP1R9BQ96SB3 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PPP1R9BQ96SB3 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PPP1R9BQ96SB3 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PPP1R9BQ96SB3 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PPP1R9BQ96SB3 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PPP1R9BQ96SB3 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PPP1R9BQ96SB3 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PPP1R9BQ96SB3 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PPP1R9BQ96SB3 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PPP1R9BQ96SB3 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PPP1R9BQ96SB3 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PPP1R9BQ96SB3 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PPP1R9BQ96SB3 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PPP1R9BQ96SB3 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PPP1R9BQ96SB3 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PPP1R9BQ96SB3 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PPP1R9BQ96SB3 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PPP1R9BQ96SB3 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PPP1R9BQ96SB3 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PPP1R9BQ96SB3 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PPP1R9BQ96SB3 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms